60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2966 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  100 
 
 		 531 aa  1082    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.05 
 
 		 4761 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0912  fibronectin, type III domain-containing protein  31.28 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 1143 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.1 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  25.4 
 
 		 4357 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.85 
 
 		 1121 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 1121 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 1121 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  26.96 
 
 		 307 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  24.05 
 
 		 848 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  32.04 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3579  Fibronectin type III domain protein  27.47 
 
 		 382 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 1112 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 804 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.47 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  43.37 
 
 		 600 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 		 703 aa  51.6  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3311  PKD domain containing protein  31.96 
 
 		 111 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1105  hypothetical protein  29.2 
 
 		 425 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.355107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1931 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  31.07 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.42 
 
 		 2176 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.81 
 
 		 3822 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  26.41 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  23.73 
 
 		 767 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  27.81 
 
 		 3861 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  38.27 
 
 		 943 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1367 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 		 598 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.35 
 
 		 846 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1916 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  21.98 
 
 		 739 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  36.36 
 
 		 873 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.88 
 
 		 1597 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  25.73 
 
 		 1159 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.79 
 
 		 1013 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  26.9 
 
 		 1708 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  43.1 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.7 
 
 		 1035 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  42.86 
 
 		 814 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  34.23 
 
 		 935 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.98 
 
 		 265 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.19 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  29 
 
 		 250 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  23.42 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  34.15 
 
 		 3507 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.56 
 
 		 1057 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  41.67 
 
 		 1565 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.08 
 
 		 1158 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2559  hypothetical protein  25.66 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 		 639 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  24.08 
 
 		 250 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  45.16 
 
 		 2066 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  24.23 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  39.71 
 
 		 865 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  44.64 
 
 		 660 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  23.38 
 
 		 741 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  23.38 
 
 		 741 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>