271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1015 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  100 
 
 
943 aa  1909    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  36.44 
 
 
646 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  36.56 
 
 
661 aa  311  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  42.64 
 
 
425 aa  310  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  42.42 
 
 
403 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.16 
 
 
1565 aa  131  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  47.06 
 
 
2066 aa  102  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  60.71 
 
 
1150 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.89 
 
 
1916 aa  95.1  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  55.42 
 
 
596 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  52.27 
 
 
816 aa  86.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
601 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  51.69 
 
 
623 aa  83.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  39.66 
 
 
861 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  59.09 
 
 
1057 aa  80.1  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.38 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.24 
 
 
773 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  48.78 
 
 
777 aa  77  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.41 
 
 
947 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  44.94 
 
 
734 aa  75.1  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 
1009 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  43.93 
 
 
873 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  36.05 
 
 
712 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  33.82 
 
 
1991 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  39.77 
 
 
1104 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  39.77 
 
 
1104 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  43.21 
 
 
1151 aa  72  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  44.58 
 
 
778 aa  72  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  44.58 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  44.58 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  44.58 
 
 
778 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 
1601 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.14 
 
 
1158 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.73 
 
 
381 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.57 
 
 
942 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  52.94 
 
 
884 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.51 
 
 
3563 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  46.34 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  33.88 
 
 
775 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.31 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  35.43 
 
 
948 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  47.76 
 
 
971 aa  67  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 
955 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.12 
 
 
386 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  40.96 
 
 
677 aa  65.1  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  38.2 
 
 
960 aa  64.7  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.71 
 
 
1200 aa  64.7  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  38.2 
 
 
960 aa  64.7  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.86 
 
 
6885 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  47.14 
 
 
792 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  41.89 
 
 
2176 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  44.19 
 
 
948 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  38.2 
 
 
960 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  42.35 
 
 
713 aa  62.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  47.69 
 
 
780 aa  62.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  35.96 
 
 
541 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  43.28 
 
 
967 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  43.02 
 
 
948 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  30.81 
 
 
734 aa  63.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  48.78 
 
 
852 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  50 
 
 
971 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  44.78 
 
 
1084 aa  61.2  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.21 
 
 
940 aa  61.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  49.25 
 
 
948 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  50 
 
 
971 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  50 
 
 
971 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.37 
 
 
945 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  48.15 
 
 
971 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  38.78 
 
 
317 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  48.15 
 
 
1018 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  39.47 
 
 
1029 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  32.54 
 
 
1027 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  43.24 
 
 
669 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  47.62 
 
 
1050 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  47.44 
 
 
487 aa  59.7  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  38.3 
 
 
1394 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  46.3 
 
 
971 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  46.3 
 
 
971 aa  58.9  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  46.3 
 
 
971 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  43.75 
 
 
840 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  46.3 
 
 
971 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 
835 aa  58.9  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.94 
 
 
460 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  43.33 
 
 
1367 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  43.21 
 
 
818 aa  58.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  41.54 
 
 
965 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  45 
 
 
938 aa  58.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.21 
 
 
836 aa  58.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  47.69 
 
 
820 aa  58.2  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  43.68 
 
 
634 aa  57.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  42.31 
 
 
944 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.74 
 
 
944 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  44.78 
 
 
552 aa  57.4  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  40 
 
 
965 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.47 
 
 
945 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  41.11 
 
 
517 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  43.08 
 
 
814 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  41.03 
 
 
944 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  41.03 
 
 
944 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  57.69 
 
 
600 aa  57  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>