81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3385 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  100 
 
 		 1931 aa  3953    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  43.56 
 
 		 2113 aa  310  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1101 aa  152  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  31.88 
 
 		 2046 aa  141  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1164 aa  115  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37 
 
 		 864 aa  110  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.13 
 
 		 1064 aa  108  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  29.14 
 
 		 2038 aa  103  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.51 
 
 		 1147 aa  96.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  31.07 
 
 		 714 aa  90.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  30.18 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  27.63 
 
 		 948 aa  82  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.38 
 
 		 2447 aa  81.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  30.07 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  27.03 
 
 		 958 aa  78.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.1 
 
 		 2178 aa  75.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.29 
 
 		 2225 aa  75.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  26.05 
 
 		 1037 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.09 
 
 		 523 aa  75.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.38 
 
 		 757 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.77 
 
 		 846 aa  70.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1367 aa  67.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25 
 
 		 6678 aa  67.4  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1375 aa  66.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 739 aa  66.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1209 aa  65.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  30.15 
 
 		 2585 aa  65.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.64 
 
 		 4761 aa  63.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  21.9 
 
 		 2224 aa  63.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  21.9 
 
 		 2224 aa  63.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  21.9 
 
 		 2224 aa  62.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  22.12 
 
 		 2246 aa  62.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.01 
 
 		 4433 aa  60.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  28.7 
 
 		 739 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.96 
 
 		 1072 aa  60.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.86 
 
 		 9585 aa  58.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  33.79 
 
 		 2031 aa  56.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 3273 aa  56.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  26.83 
 
 		 1413 aa  55.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  22.45 
 
 		 2221 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.44 
 
 		 1735 aa  55.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  29.31 
 
 		 2318 aa  55.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1265 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.79 
 
 		 1310 aa  53.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1504 aa  52.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.11 
 
 		 1424 aa  52.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  29.26 
 
 		 3907 aa  52.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  28.84 
 
 		 981 aa  52.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  27.78 
 
 		 420 aa  52  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  27.05 
 
 		 508 aa  51.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 531 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.67 
 
 		 11716 aa  51.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.74 
 
 		 236 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0018  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1020 aa  50.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.23 
 
 		 1306 aa  50.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  35.56 
 
 		 4357 aa  50.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.59 
 
 		 1679 aa  50.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.52 
 
 		 767 aa  50.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 804 aa  50.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  23.26 
 
 		 471 aa  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  25.59 
 
 		 2215 aa  49.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2370  hypothetical protein  25.95 
 
 		 216 aa  49.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0389898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  23.58 
 
 		 252 aa  49.7  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  28.77 
 
 		 258 aa  49.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  27.04 
 
 		 1025 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.34 
 
 		 456 aa  48.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  24.9 
 
 		 247 aa  48.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0805  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  47.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2674  hypothetical protein  29.63 
 
 		 359 aa  47.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1054 aa  47.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5765  hypothetical protein  26.34 
 
 		 593 aa  48.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.08 
 
 		 754 aa  47  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.74 
 
 		 273 aa  47.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  30.97 
 
 		 1577 aa  47.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.12 
 
 		 1013 aa  47  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  29.41 
 
 		 493 aa  46.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  22.79 
 
 		 316 aa  46.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  25.31 
 
 		 247 aa  46.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  29.41 
 
 		 492 aa  46.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  23.16 
 
 		 643 aa  46.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 703 aa  45.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>