173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3165 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  100 
 
 		 2031 aa  4066    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1101 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  31.81 
 
 		 1164 aa  156  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.21 
 
 		 1147 aa  151  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  34.13 
 
 		 948 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  33.51 
 
 		 958 aa  141  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1375 aa  130  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  26.9 
 
 		 1037 aa  121  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1209 aa  104  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 2046 aa  95.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  31.54 
 
 		 2038 aa  90.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2113 aa  79  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1931 aa  73.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 		 1072 aa  73.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.03 
 
 		 1024 aa  73.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  34.48 
 
 		 930 aa  70.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.78 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  40.56 
 
 		 516 aa  68.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  29.59 
 
 		 861 aa  67.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 		 1601 aa  66.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 		 2066 aa  65.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  42.98 
 
 		 1150 aa  64.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  41.9 
 
 		 1916 aa  63.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  34.97 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.97 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  44.71 
 
 		 917 aa  62.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  30.82 
 
 		 634 aa  62.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  37.84 
 
 		 597 aa  62  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.86 
 
 		 2447 aa  62  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.33 
 
 		 2225 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 732 aa  61.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  35.11 
 
 		 1104 aa  60.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1057 aa  59.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  38.93 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.82 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  34.06 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  34.04 
 
 		 1104 aa  58.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  27.51 
 
 		 1018 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  20.65 
 
 		 2178 aa  58.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.1 
 
 		 497 aa  58.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.87 
 
 		 816 aa  58.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  32.61 
 
 		 373 aa  58.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.76 
 
 		 490 aa  57.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.09 
 
 		 1371 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 452 aa  57.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.7 
 
 		 648 aa  56.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.04 
 
 		 551 aa  56.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  28.88 
 
 		 669 aa  56.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  37.35 
 
 		 650 aa  56.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.2 
 
 		 794 aa  55.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.46 
 
 		 526 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 492 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.41 
 
 		 1207 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1682 aa  54.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  41.18 
 
 		 873 aa  54.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.56 
 
 		 476 aa  54.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  43.66 
 
 		 943 aa  54.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  41.1 
 
 		 967 aa  54.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 446 aa  54.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  57.14 
 
 		 852 aa  53.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.39 
 
 		 2272 aa  53.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  26.15 
 
 		 2585 aa  53.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  29.08 
 
 		 803 aa  53.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  36.72 
 
 		 1094 aa  53.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.31 
 
 		 1158 aa  53.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.1 
 
 		 498 aa  53.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.23 
 
 		 261 aa  53.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.59 
 
 		 910 aa  52.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  36.63 
 
 		 712 aa  52.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  50 
 
 		 1151 aa  52.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.5 
 
 		 516 aa  52.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.88 
 
 		 2176 aa  52.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  40.22 
 
 		 623 aa  52.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  27.83 
 
 		 522 aa  52.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  49.09 
 
 		 386 aa  52.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.06 
 
 		 2036 aa  52  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  30.86 
 
 		 820 aa  52  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.26 
 
 		 1602 aa  51.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  28.47 
 
 		 496 aa  51.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.39 
 
 		 2122 aa  51.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 493 aa  51.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  29.58 
 
 		 384 aa  51.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.3 
 
 		 1300 aa  50.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.06 
 
 		 6885 aa  50.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  29.53 
 
 		 955 aa  50.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  20.05 
 
 		 2246 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  31.45 
 
 		 1241 aa  50.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  34.41 
 
 		 859 aa  50.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  28.78 
 
 		 929 aa  50.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  35.29 
 
 		 677 aa  50.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  32.12 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.93 
 
 		 3197 aa  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  19.52 
 
 		 2224 aa  50.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  36.11 
 
 		 960 aa  50.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.56 
 
 		 639 aa  50.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  31.45 
 
 		 1120 aa  50.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.45 
 
 		 2000 aa  50.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  19.52 
 
 		 2224 aa  50.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  36.11 
 
 		 960 aa  50.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.22 
 
 		 423 aa  50.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>