254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2750 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  100 
 
 		 2447 aa  4963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  31.73 
 
 		 2215 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.81 
 
 		 2178 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  28.28 
 
 		 2225 aa  135  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.69 
 
 		 2246 aa  122  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  28.28 
 
 		 2113 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.23 
 
 		 2224 aa  117  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.23 
 
 		 2224 aa  117  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.23 
 
 		 2224 aa  117  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  27.91 
 
 		 2221 aa  116  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  29.55 
 
 		 1531 aa  112  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 2038 aa  107  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 2046 aa  102  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  28.98 
 
 		 3273 aa  94.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.8 
 
 		 678 aa  93.6  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.37 
 
 		 14944 aa  90.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.97 
 
 		 1206 aa  87.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  29.36 
 
 		 2585 aa  86.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1504 aa  86.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.05 
 
 		 1147 aa  82.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 361 aa  82  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1600 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1101 aa  82  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1931 aa  80.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.43 
 
 		 2277 aa  80.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  30.8 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.96 
 
 		 1271 aa  80.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.24 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.11 
 
 		 904 aa  77.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  33.59 
 
 		 978 aa  77.4  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 3193 aa  77.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1840 aa  77.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.92 
 
 		 2349 aa  76.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1959 aa  76.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1917 aa  75.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.91 
 
 		 1008 aa  72.8  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.91 
 
 		 1008 aa  72.8  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1942 aa  70.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  29.41 
 
 		 382 aa  70.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.7 
 
 		 4761 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1352 aa  70.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.16 
 
 		 1298 aa  69.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  27.39 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  25.53 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.88 
 
 		 1732 aa  69.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  44.44 
 
 		 577 aa  69.3  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  23.96 
 
 		 2658 aa  68.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.97 
 
 		 841 aa  68.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.3 
 
 		 2350 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  25.24 
 
 		 504 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  29.7 
 
 		 918 aa  67.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  31.33 
 
 		 2252 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1669 aa  67.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  26.69 
 
 		 3507 aa  67.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  26.39 
 
 		 1398 aa  66.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1375 aa  66.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1164 aa  66.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  36.51 
 
 		 886 aa  66.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.73 
 
 		 2096 aa  65.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.59 
 
 		 3027 aa  65.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  27.27 
 
 		 1141 aa  64.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1559 aa  63.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 2961 aa  63.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  23.25 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  28.02 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  25.8 
 
 		 1426 aa  63.2  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1426 aa  63.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  25.8 
 
 		 1426 aa  62.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  25.18 
 
 		 5236 aa  63.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.75 
 
 		 1345 aa  62.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.75 
 
 		 1345 aa  62.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27 
 
 		 1464 aa  62.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25.93 
 
 		 2387 aa  62.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  25.8 
 
 		 1429 aa  62.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 3073 aa  62.4  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.83 
 
 		 1400 aa  62.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.72 
 
 		 2149 aa  62  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  25.18 
 
 		 5189 aa  62.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1268 aa  62  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 831 aa  62  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1216 aa  61.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.43 
 
 		 1140 aa  62  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  33.52 
 
 		 958 aa  61.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  25.8 
 
 		 1200 aa  60.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.16 
 
 		 6678 aa  60.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  31.62 
 
 		 2413 aa  59.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1763 aa  59.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1547 aa  59.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 2486 aa  59.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  30.14 
 
 		 2318 aa  58.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  28.3 
 
 		 613 aa  59.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 2294 aa  58.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  25 
 
 		 1405 aa  58.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.78 
 
 		 1384 aa  58.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  29.23 
 
 		 1072 aa  58.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  29.02 
 
 		 1595 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1520 aa  57.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.06 
 
 		 1614 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25 
 
 		 2290 aa  57.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>