25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1175    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  40.89 
 
 		 2113 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.03 
 
 		 2585 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 2038 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  37.74 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  36.96 
 
 		 2046 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  32.56 
 
 		 1531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  32.18 
 
 		 2447 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  28.15 
 
 		 2215 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  28.86 
 
 		 1053 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 3273 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.57 
 
 		 2224 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.57 
 
 		 2224 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.57 
 
 		 2224 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0351  hypothetical protein  33.8 
 
 		 75 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000592676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 869 aa  47.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.03 
 
 		 2225 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  35.11 
 
 		 391 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  39.77 
 
 		 2194 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.08 
 
 		 2246 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  46.81 
 
 		 1199 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1172 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  36.7 
 
 		 311 aa  44.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  52.27 
 
 		 1433 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  26.78 
 
 		 400 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>