50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3427 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 451 aa  899    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  85.09 
 
 		 2585 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  42.63 
 
 		 2113 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  39.57 
 
 		 2046 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  36.4 
 
 		 2038 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  36.72 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  31.82 
 
 		 1531 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.03 
 
 		 2447 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 869 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  32.96 
 
 		 2215 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1763 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2749  YD repeat protein  43.24 
 
 		 2808 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  29.62 
 
 		 2387 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  40.28 
 
 		 2076 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1600 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  41.18 
 
 		 1405 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1559 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  32.46 
 
 		 1352 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  25.27 
 
 		 902 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2762 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  28.49 
 
 		 2731 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.14 
 
 		 678 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  44.07 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  39.47 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  36.56 
 
 		 2191 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  35.44 
 
 		 240 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  39.22 
 
 		 378 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  23.85 
 
 		 1710 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  34.09 
 
 		 1840 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  30.05 
 
 		 1053 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  35.44 
 
 		 376 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 3273 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  26.69 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 2961 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  34.38 
 
 		 1271 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  28.66 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1278  cell wall-associated protein  24.47 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  32.71 
 
 		 2277 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  27.34 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  27.04 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  35.59 
 
 		 2615 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  26.85 
 
 		 2413 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 2831 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  24.03 
 
 		 2165 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1090 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.05 
 
 		 2096 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>