189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3428 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  100 
 
 
2585 aa  5185    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  85.09 
 
 
451 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  33.05 
 
 
2038 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  33.78 
 
 
2113 aa  387  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  33.51 
 
 
2046 aa  363  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  29.67 
 
 
1531 aa  266  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.74 
 
 
1147 aa  183  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  30.47 
 
 
1037 aa  179  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  28.44 
 
 
958 aa  170  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  27.65 
 
 
948 aa  162  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  29.6 
 
 
1101 aa  157  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  24.97 
 
 
1164 aa  136  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  35.9 
 
 
577 aa  130  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.42 
 
 
1931 aa  105  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  33.47 
 
 
1140 aa  102  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 
2615 aa  102  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 
1391 aa  95.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  35.48 
 
 
2290 aa  91.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 
3273 aa  91.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.64 
 
 
2447 aa  90.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  41.38 
 
 
614 aa  89  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  38.56 
 
 
2286 aa  86.7  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  37.96 
 
 
238 aa  83.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  27.88 
 
 
2215 aa  82.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  36.21 
 
 
400 aa  81.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  26.44 
 
 
2387 aa  79.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  36.84 
 
 
558 aa  78.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 
1352 aa  78.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  37.72 
 
 
251 aa  78.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  35.93 
 
 
401 aa  77.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  36.75 
 
 
334 aa  74.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  30.42 
 
 
566 aa  74.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.67 
 
 
1271 aa  73.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  25.62 
 
 
1053 aa  73.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  36.14 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.27 
 
 
2731 aa  72.8  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  38.1 
 
 
615 aa  72.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  39.58 
 
 
471 aa  72.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  37.41 
 
 
615 aa  72  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.04 
 
 
2096 aa  71.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  37.41 
 
 
615 aa  71.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  26.61 
 
 
1763 aa  71.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  38.19 
 
 
613 aa  70.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  23.46 
 
 
678 aa  70.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  37.41 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  35.62 
 
 
268 aa  68.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  37.93 
 
 
3073 aa  69.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  31.72 
 
 
508 aa  67.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  36.05 
 
 
450 aa  68.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  21.82 
 
 
869 aa  67  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.18 
 
 
2277 aa  65.9  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  35.37 
 
 
333 aa  64.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  23.53 
 
 
902 aa  64.3  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4167  hypothetical protein  29.81 
 
 
382 aa  63.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000267335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  38.85 
 
 
456 aa  63.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.23 
 
 
1485 aa  62.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  26.92 
 
 
1559 aa  62.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  27.49 
 
 
716 aa  61.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  25.52 
 
 
701 aa  61.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 
1268 aa  60.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  28.96 
 
 
2542 aa  61.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.78 
 
 
3027 aa  60.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  30.62 
 
 
1528 aa  60.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 
2035 aa  60.1  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  28.14 
 
 
1209 aa  59.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.22 
 
 
1539 aa  59.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  26.53 
 
 
574 aa  58.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  22.7 
 
 
2031 aa  58.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 
1600 aa  59.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.22 
 
 
2149 aa  59.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  34.48 
 
 
1953 aa  57.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 
1197 aa  57  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  25.19 
 
 
575 aa  57  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.33 
 
 
2144 aa  56.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.06 
 
 
1539 aa  56.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  34.35 
 
 
2486 aa  56.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  25.19 
 
 
581 aa  56.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  30.24 
 
 
1375 aa  56.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.76 
 
 
1560 aa  56.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.01 
 
 
2225 aa  56.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.29 
 
 
1485 aa  55.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.69 
 
 
1572 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 
1390 aa  55.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.38 
 
 
2658 aa  55.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.69 
 
 
1620 aa  55.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.14 
 
 
1673 aa  55.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.51 
 
 
1550 aa  55.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  29.28 
 
 
1400 aa  55.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 
1917 aa  55.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24 
 
 
2224 aa  55.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  26.6 
 
 
1429 aa  55.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.41 
 
 
1509 aa  54.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  26.35 
 
 
1417 aa  54.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.25 
 
 
1488 aa  53.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  24.73 
 
 
1398 aa  53.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.21 
 
 
1679 aa  53.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.4 
 
 
1614 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.3 
 
 
1959 aa  53.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  41.67 
 
 
2076 aa  53.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 
1602 aa  53.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>