69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1782 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  784    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  33.85 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  54.55 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  47.37 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  46.43 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  43.75 
 
 		 308 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  48.51 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  57.32 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  51.09 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  50.5 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  50.54 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  45.53 
 
 		 218 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  53.75 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  55 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  60.29 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  52.87 
 
 		 265 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  52.33 
 
 		 274 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  38.73 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  54.32 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  51.69 
 
 		 263 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  53.49 
 
 		 262 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  37.32 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  50.56 
 
 		 1669 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  49.43 
 
 		 237 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  47.78 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  53.66 
 
 		 122 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  64.52 
 
 		 265 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  41.41 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  64.06 
 
 		 295 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  48.86 
 
 		 246 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  54.12 
 
 		 264 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  48.35 
 
 		 322 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  37.41 
 
 		 1562 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  57.58 
 
 		 1698 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  45.71 
 
 		 207 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1632 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  64.52 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  62.3 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  41.27 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  45.78 
 
 		 249 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  45.22 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  50.63 
 
 		 1578 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  51.85 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  41.84 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  47.87 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  42.7 
 
 		 1682 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  41.12 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  49.37 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  42.7 
 
 		 982 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  37.82 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  53.23 
 
 		 1559 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  46.34 
 
 		 1723 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1658 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  43.9 
 
 		 1689 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.94 
 
 		 2277 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  39.22 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  43.08 
 
 		 2447 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1834 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  41.18 
 
 		 2585 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1147 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  41.94 
 
 		 2350 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 1600 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  39.06 
 
 		 690 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  39.13 
 
 		 2510 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  41.54 
 
 		 2387 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  42.59 
 
 		 1710 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>