94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4091 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  812    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  43.66 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  37.77 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  64.52 
 
 		 265 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  59.78 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  36.67 
 
 		 1669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  69.7 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  69.23 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  68.18 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  64.79 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  61.97 
 
 		 1632 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  32 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  64.62 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  66.15 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  63.01 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  36.87 
 
 		 1682 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1559 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  67.69 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  60.26 
 
 		 1578 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  40.7 
 
 		 243 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  48.57 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  63.64 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  60 
 
 		 264 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  60.29 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  47.17 
 
 		 1698 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  54.05 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  67.74 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  67.16 
 
 		 1562 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  52.5 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  63.08 
 
 		 322 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  64.52 
 
 		 237 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  59.38 
 
 		 982 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  62.5 
 
 		 263 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  61.54 
 
 		 122 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  62.9 
 
 		 246 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  63.49 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1689 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  59.09 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  63.08 
 
 		 262 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  55.56 
 
 		 249 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  63.49 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  61.29 
 
 		 240 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  60.32 
 
 		 218 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  47.25 
 
 		 265 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  60.94 
 
 		 300 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  57.81 
 
 		 316 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  45.98 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  55.38 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  53.73 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  54.84 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 1723 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  56.45 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  55.56 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  42.47 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  51.52 
 
 		 1658 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  45.16 
 
 		 1942 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  45.16 
 
 		 1917 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1623 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  43.04 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2349 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  36.84 
 
 		 628 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  43.55 
 
 		 1840 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  43.48 
 
 		 1959 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.54 
 
 		 2277 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.01 
 
 		 2094 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  45.83 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  45.83 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  25.5 
 
 		 2165 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  43.28 
 
 		 2658 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  46.81 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1669 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  36.04 
 
 		 2554 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  37.21 
 
 		 2558 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  44.07 
 
 		 2494 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1825 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 2031 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1806 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 2031 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  34.48 
 
 		 2032 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  34.21 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1763 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1825 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  34.48 
 
 		 2031 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.74 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  41.79 
 
 		 1568 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  33.94 
 
 		 2387 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  43.08 
 
 		 3273 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  36.89 
 
 		 2350 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1834 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  39.06 
 
 		 2615 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 869 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  38.24 
 
 		 3073 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  45.31 
 
 		 2961 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>