69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2466 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  61.86 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  55 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  55.96 
 
 		 363 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  58.16 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  65.88 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  56.31 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  62.5 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  53.4 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  56.04 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  60.24 
 
 		 1632 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  67.69 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  56.63 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  57.83 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  49.07 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  60.76 
 
 		 218 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  46.55 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  53.54 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  59.76 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  56.96 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  56.79 
 
 		 122 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  53.57 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  57.14 
 
 		 246 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  54.88 
 
 		 1698 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  47.78 
 
 		 249 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  56.25 
 
 		 1682 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  55.42 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  64.06 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  43.4 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  53.75 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  58.33 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  59.38 
 
 		 1578 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  63.08 
 
 		 344 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  49.46 
 
 		 376 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  51.72 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  54.88 
 
 		 1669 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  55 
 
 		 982 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  53.09 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  48.48 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  54.76 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  53.57 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  55 
 
 		 1559 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  53.75 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  50.56 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  50.63 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  50.6 
 
 		 207 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  61.54 
 
 		 1562 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  51.25 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  53.16 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  51.95 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  47.87 
 
 		 1723 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  41.88 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  51.9 
 
 		 1658 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  49.37 
 
 		 1689 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  42.5 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  31.19 
 
 		 2277 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  37.37 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  37.21 
 
 		 628 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  39.76 
 
 		 2961 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1917 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 1942 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  35.06 
 
 		 1959 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  41.54 
 
 		 1623 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  36.9 
 
 		 3273 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  38.3 
 
 		 1834 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1840 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1763 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>