72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4719 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  70.89 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  78.95 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  50.99 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  55.78 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  60.34 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  52.33 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  43.66 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  49.45 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  47.9 
 
 		 1578 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  44.02 
 
 		 1562 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  41.62 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  38.64 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  57 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  39.01 
 
 		 1682 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  58.41 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  31.44 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  43.1 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  45.58 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  56.86 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  36.56 
 
 		 982 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  45.77 
 
 		 303 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1632 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  53.4 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  32 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  48.8 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  43.42 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  52.48 
 
 		 274 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  55.56 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  49.48 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  51 
 
 		 218 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  40.91 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  34.21 
 
 		 1698 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  39.85 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  51.72 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  49.45 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  47.78 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  53.57 
 
 		 257 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  32.19 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  45.97 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  45.05 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  36.87 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  58.75 
 
 		 262 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  32.35 
 
 		 1669 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  54.43 
 
 		 240 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  29.18 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1559 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1723 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  38.52 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  52.44 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  58.06 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1689 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  39.25 
 
 		 1658 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  45.76 
 
 		 1763 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  41.56 
 
 		 2277 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  40.58 
 
 		 1791 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  30.32 
 
 		 869 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  37.37 
 
 		 1433 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  38.68 
 
 		 1147 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  44.12 
 
 		 2387 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  39.34 
 
 		 1942 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 690 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  33.64 
 
 		 3273 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  37.7 
 
 		 1917 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  38 
 
 		 605 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  31.82 
 
 		 1599 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  41.94 
 
 		 2961 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1840 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>