82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4878 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  60.43 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  36.82 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  48.28 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  37.82 
 
 		 328 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  37.65 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  45.52 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  36.65 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  40.24 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  39.74 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  35.61 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  39.86 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  38.65 
 
 		 1698 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  42.26 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1578 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  40.85 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  40.79 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  40.91 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1682 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  37.93 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  38.55 
 
 		 1562 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  36.81 
 
 		 982 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  36.81 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  41.55 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  41.26 
 
 		 1559 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1632 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  43.48 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  41.18 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  40.3 
 
 		 1669 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  48.48 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  60.94 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  51.85 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  48.57 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  53.85 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  49.37 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  36.61 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  61.9 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  53.09 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  44.83 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  50.63 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1658 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  41.41 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2826  hypothetical protein  59.38 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0654843  normal  0.169025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  32.87 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3013  hypothetical protein  60.32 
 
 		 83 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165053  normal  0.0429023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  43.69 
 
 		 1723 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  55.38 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  49.37 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  48.1 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  47.56 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  52.38 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2680  hypothetical protein  54.69 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  50.77 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  39.64 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1689 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  44.21 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  43.75 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  52.38 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1763 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1959 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 2961 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  40.85 
 
 		 2387 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  31.69 
 
 		 2831 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  25.14 
 
 		 2413 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  31.68 
 
 		 1840 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  31.67 
 
 		 1710 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  26.11 
 
 		 722 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  33.65 
 
 		 1599 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  42.42 
 
 		 2447 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1942 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  38.57 
 
 		 903 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  29.52 
 
 		 2277 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1917 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  29.69 
 
 		 1732 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  25.66 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  32.63 
 
 		 2458 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  33.67 
 
 		 1271 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 869 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  46.94 
 
 		 2350 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  27.5 
 
 		 2165 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>