60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1780 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  33.85 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  54 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  49.5 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  52.94 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  58.02 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  42.18 
 
 		 331 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  55.7 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  35.71 
 
 		 348 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  54.74 
 
 		 332 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  53.57 
 
 		 359 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  46.6 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  56.63 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  51.16 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  51.81 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50.62 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  34.6 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  47.73 
 
 		 322 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  63.49 
 
 		 401 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  53.66 
 
 		 363 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  48.78 
 
 		 1698 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  69.35 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  53.57 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  55.56 
 
 		 338 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  31.89 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  53.01 
 
 		 1578 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  56.1 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  49.43 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  56.79 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  52.17 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  47.47 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  51.16 
 
 		 207 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  52.94 
 
 		 237 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  53.09 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  53.09 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  50 
 
 		 1562 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1632 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  52.5 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  47.83 
 
 		 1669 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  44.17 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  47.5 
 
 		 1682 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  51.02 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  58.06 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  57.35 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  50.63 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  59.42 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  69.39 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1559 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  48.81 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  42.22 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  46.51 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  41.98 
 
 		 1658 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  53.12 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  51.61 
 
 		 1689 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  42.7 
 
 		 1723 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.91 
 
 		 2277 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  34.88 
 
 		 1338 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1604 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>