70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4893 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  39.33 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  55.24 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  55 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  52.83 
 
 		 363 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  55.77 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  36.6 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  48.15 
 
 		 371 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  51.49 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  55.56 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  50.94 
 
 		 380 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  42.03 
 
 		 331 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  60.26 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  46.55 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  48.57 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  56.96 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  46.79 
 
 		 982 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  47.96 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  55.56 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  46.79 
 
 		 1682 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  49.07 
 
 		 1632 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  41.3 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  44.23 
 
 		 328 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  54.02 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  49.52 
 
 		 303 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  64.52 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  55.13 
 
 		 122 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  44.12 
 
 		 313 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1578 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  46.6 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  55.42 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  69.81 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  56.63 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  55.84 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  51.14 
 
 		 207 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  48.42 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  44 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  42.34 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  47.25 
 
 		 401 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  51.81 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  53.85 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  45.95 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  46.74 
 
 		 1698 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  51.25 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  43.12 
 
 		 1658 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  52.56 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  53.09 
 
 		 1562 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  42.59 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  41.01 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  45.78 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  44.76 
 
 		 1723 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  52.7 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  47.56 
 
 		 1669 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 1689 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  50 
 
 		 1559 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  30.37 
 
 		 628 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  49.09 
 
 		 1338 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  35.16 
 
 		 2447 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  36.92 
 
 		 2113 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  41.1 
 
 		 2350 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  34.83 
 
 		 738 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  35.48 
 
 		 2277 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  31.03 
 
 		 2585 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  36.36 
 
 		 2349 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  32.18 
 
 		 451 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1517 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  34.41 
 
 		 2194 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  32.81 
 
 		 989 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>