96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4877 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  49.32 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  49.66 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  43.24 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  48.63 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  47.44 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  47.68 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  45.68 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  49.32 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  46.53 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  48 
 
 		 1578 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  42.86 
 
 		 982 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  34.54 
 
 		 1562 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  44.06 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  39.23 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1682 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  31.44 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  50.45 
 
 		 1632 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  43.84 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  37.88 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  43.71 
 
 		 1698 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  41.78 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  38.01 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  72.58 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  43.75 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  57.14 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  52.43 
 
 		 1723 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  32.97 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  51.46 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  56.25 
 
 		 218 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  58.62 
 
 		 122 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  52.94 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  59.04 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  45.28 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  51.65 
 
 		 1689 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  43.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  69.81 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  54.88 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  63.49 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  45.76 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  51.9 
 
 		 207 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  44.57 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  38.62 
 
 		 1658 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  54.88 
 
 		 246 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  31.89 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  50.56 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  55.07 
 
 		 240 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  48.28 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  53.95 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  41.28 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  49.37 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  56.06 
 
 		 1559 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  56.14 
 
 		 1669 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2680  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3013  hypothetical protein  48.33 
 
 		 83 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165053  normal  0.0429023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2826  hypothetical protein  43.33 
 
 		 66 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0654843  normal  0.169025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  32.54 
 
 		 2277 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1149 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.85 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  41.18 
 
 		 1381 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  32.98 
 
 		 1599 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  38.03 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 2035 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 690 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  43.55 
 
 		 1623 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  35.42 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  29.38 
 
 		 1046 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  42.19 
 
 		 927 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 2031 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  42 
 
 		 2031 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1840 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  41.94 
 
 		 1338 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  32.71 
 
 		 1732 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 1806 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  38.81 
 
 		 956 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 1825 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 1825 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  32.71 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 2032 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  42 
 
 		 2031 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.62 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  41.1 
 
 		 2658 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  42.68 
 
 		 1576 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  48.94 
 
 		 628 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  35.48 
 
 		 989 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  27.16 
 
 		 451 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1433 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  30.43 
 
 		 554 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  36.76 
 
 		 207 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  40 
 
 		 903 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 955 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  37.66 
 
 		 738 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>