More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2293 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  89.41 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  41.47 
 
 		 917 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  44.05 
 
 		 705 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  65 
 
 		 741 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  56 
 
 		 788 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  56 
 
 		 788 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  69.7 
 
 		 903 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  59.49 
 
 		 1381 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  55.05 
 
 		 764 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  58.14 
 
 		 319 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  66.15 
 
 		 690 aa  98.6  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  46.79 
 
 		 913 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  56.96 
 
 		 927 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2441  hypothetical protein  72.88 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  64.71 
 
 		 605 aa  94.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  66.67 
 
 		 738 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  59.42 
 
 		 1467 aa  92  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  51.9 
 
 		 890 aa  91.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  55.84 
 
 		 1433 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  51.9 
 
 		 1577 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  48.28 
 
 		 1528 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  43.56 
 
 		 920 aa  84.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  54.17 
 
 		 1338 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  57.81 
 
 		 1390 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  61.02 
 
 		 1429 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  60.87 
 
 		 1301 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  36.64 
 
 		 613 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  48.84 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  52.94 
 
 		 1379 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  61.02 
 
 		 1626 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3724  Rhs family protein-like protein  47.87 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0108015  hitchhiker  0.00111387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  39.09 
 
 		 1620 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  61.67 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  61.02 
 
 		 1348 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  48.68 
 
 		 2144 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  43.48 
 
 		 1488 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  51.76 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  51.25 
 
 		 1418 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  62.9 
 
 		 1189 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  42.34 
 
 		 1359 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  45.26 
 
 		 1402 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3727  hypothetical protein  53.62 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00259449  hitchhiker  0.0064722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  61.29 
 
 		 1527 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  46.34 
 
 		 1770 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  56.25 
 
 		 1654 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  52 
 
 		 1390 aa  74.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3726  hypothetical protein  57.38 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01295  hitchhiker  0.00196674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  56.06 
 
 		 1568 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  49.33 
 
 		 889 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  59.32 
 
 		 1550 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  49.38 
 
 		 1525 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  50.6 
 
 		 682 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0521  Rhs family protein-like protein  42.19 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  68.09 
 
 		 867 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  57.63 
 
 		 1791 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  61.02 
 
 		 1611 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  39.8 
 
 		 1981 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.81 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  50.6 
 
 		 1200 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1216 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  40.38 
 
 		 1419 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  58.33 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  44.58 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  60 
 
 		 1446 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  44.44 
 
 		 1599 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  53.42 
 
 		 583 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  53.42 
 
 		 1551 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1381 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1825  Rhs family protein  57.63 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.337988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  52.94 
 
 		 1583 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  43.53 
 
 		 1409 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  58.33 
 
 		 1531 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  51.95 
 
 		 586 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  58.33 
 
 		 924 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  38 
 
 		 1199 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1541 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  58.33 
 
 		 1421 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  37.37 
 
 		 1400 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  57.63 
 
 		 1384 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1547 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  56.67 
 
 		 1560 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  51.61 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  59.32 
 
 		 1614 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  55.93 
 
 		 553 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  50 
 
 		 1556 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  57.14 
 
 		 1553 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3695  hypothetical protein  45.88 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.63687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  45.88 
 
 		 1699 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  51.39 
 
 		 1411 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  36.05 
 
 		 1426 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  51.39 
 
 		 1411 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  46.91 
 
 		 1509 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  47.83 
 
 		 598 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>