More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2231 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1825 aa  3613    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  98.48 
 
 		 2031 aa  3466    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  99.95 
 
 		 1825 aa  3611    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  99.61 
 
 		 1806 aa  3440    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  98.1 
 
 		 2031 aa  3425    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  92.36 
 
 		 2032 aa  3320    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  98.27 
 
 		 2031 aa  3458    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.78 
 
 		 1976 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  29.09 
 
 		 2443 aa  248  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.4 
 
 		 2479 aa  240  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  24.39 
 
 		 2035 aa  229  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.49 
 
 		 2059 aa  228  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.78 
 
 		 2510 aa  204  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 2558 aa  189  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  27.36 
 
 		 2534 aa  184  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.81 
 
 		 2652 aa  180  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  24.87 
 
 		 2554 aa  166  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  29.55 
 
 		 2698 aa  164  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1834 aa  163  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.97 
 
 		 2117 aa  146  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  24.12 
 
 		 1489 aa  145  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1517 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  25.4 
 
 		 1496 aa  136  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 927 aa  135  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  23.1 
 
 		 1505 aa  133  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.16 
 
 		 2096 aa  133  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  23.82 
 
 		 1446 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.67 
 
 		 2017 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 690 aa  125  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.37 
 
 		 1271 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 628 aa  123  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 		 1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 		 1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 		 1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  24.47 
 
 		 1447 aa  120  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.24 
 
 		 903 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.48 
 
 		 889 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  25.7 
 
 		 1528 aa  114  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  25.04 
 
 		 1485 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.94 
 
 		 1577 aa  111  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.57 
 
 		 2458 aa  108  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.57 
 
 		 2417 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  21.65 
 
 		 2075 aa  104  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  22.25 
 
 		 2138 aa  103  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.32 
 
 		 2145 aa  102  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.06 
 
 		 741 aa  100  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 2961 aa  100  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.22 
 
 		 788 aa  100  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.22 
 
 		 788 aa  100  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.68 
 
 		 1467 aa  98.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.81 
 
 		 764 aa  97.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.13 
 
 		 1381 aa  97.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.04 
 
 		 3027 aa  97.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.87 
 
 		 2094 aa  95.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1600 aa  95.5  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.49 
 
 		 705 aa  94.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 3193 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.06 
 
 		 2076 aa  93.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 2831 aa  93.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.8 
 
 		 2290 aa  92  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 913 aa  92  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1433 aa  91.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  24.65 
 
 		 1008 aa  89.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  24.65 
 
 		 1008 aa  89.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1959 aa  89.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  22.52 
 
 		 1427 aa  87.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.94 
 
 		 1595 aa  87  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1197 aa  86.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.29 
 
 		 1576 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.94 
 
 		 1586 aa  85.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  24.45 
 
 		 1345 aa  85.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  24.45 
 
 		 1345 aa  85.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.09 
 
 		 1599 aa  85.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1352 aa  85.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  22.31 
 
 		 2165 aa  84.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.4 
 
 		 1732 aa  84  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1763 aa  83.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.38 
 
 		 2277 aa  82.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  21.21 
 
 		 2428 aa  82.8  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.11 
 
 		 1140 aa  82.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 2294 aa  82  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1198 aa  82  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  27.96 
 
 		 468 aa  81.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1488 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1390 aa  80.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.29 
 
 		 738 aa  80.1  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.23 
 
 		 3456 aa  79  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.41 
 
 		 1560 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.28 
 
 		 2497 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2953  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1127 aa  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 2374 aa  77.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1528 aa  77.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 3073 aa  77  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.51 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23.05 
 
 		 917 aa  74.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 		 474 aa  73.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1942 aa  73.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  25.17 
 
 		 2513 aa  73.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  27.82 
 
 		 2194 aa  72.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>