256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2231 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  100 
 
 		 982 aa  2018    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  54.97 
 
 		 1682 aa  976    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1632 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1658 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  35.04 
 
 		 1689 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  31.59 
 
 		 1723 aa  393  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  34.16 
 
 		 1578 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  34.21 
 
 		 1562 aa  350  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3829  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1281 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.799516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1290 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0257374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1497  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1283 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.81189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1461  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1312 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1698 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1559 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  24.91 
 
 		 1669 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  43.45 
 
 		 363 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  42.39 
 
 		 359 aa  144  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  46.39 
 
 		 331 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  40.59 
 
 		 371 aa  135  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  40.91 
 
 		 380 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  40.83 
 
 		 352 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  42.86 
 
 		 308 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  38.64 
 
 		 338 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  38.1 
 
 		 332 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  36.56 
 
 		 348 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1230 aa  108  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  38.78 
 
 		 317 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  45.87 
 
 		 344 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4092  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1267 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  33.54 
 
 		 322 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  66.67 
 
 		 265 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  41.13 
 
 		 316 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  37.16 
 
 		 274 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  46.79 
 
 		 265 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  38.89 
 
 		 401 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  56.25 
 
 		 312 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  35.92 
 
 		 303 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  46.85 
 
 		 264 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  36.81 
 
 		 300 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  55 
 
 		 262 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  51.81 
 
 		 237 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1917 aa  90.1  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  37.14 
 
 		 322 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  50.53 
 
 		 246 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.68 
 
 		 1572 aa  89  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  55 
 
 		 295 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  51.19 
 
 		 240 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  52.94 
 
 		 263 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  49.45 
 
 		 122 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  48.81 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  53.66 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.85 
 
 		 2277 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  49.37 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  44 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1942 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  44.23 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1623 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  32.87 
 
 		 307 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  42.7 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1840 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  57.14 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1433 aa  78.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  53.03 
 
 		 376 aa  77.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  21.8 
 
 		 1352 aa  77  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.84 
 
 		 1599 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  22.53 
 
 		 927 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  23.11 
 
 		 920 aa  74.7  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  45.83 
 
 		 290 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  50.65 
 
 		 285 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  40.38 
 
 		 275 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24 
 
 		 1576 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1419 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 690 aa  72  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.83 
 
 		 1381 aa  72  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.03 
 
 		 3027 aa  71.2  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.14 
 
 		 738 aa  70.5  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.32 
 
 		 1679 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.13 
 
 		 1959 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2096 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21 
 
 		 2035 aa  68.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0987  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.66 
 
 		 1673 aa  68.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1620 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.31 
 
 		 1614 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24.51 
 
 		 605 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1669 aa  67  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23 
 
 		 917 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.78 
 
 		 1981 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  21.54 
 
 		 2246 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 2294 aa  65.1  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.61 
 
 		 1384 aa  64.7  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.62 
 
 		 2149 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  21.79 
 
 		 1271 aa  63.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4111  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1687 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  21.9 
 
 		 2225 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  21.09 
 
 		 2221 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>