69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4303 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  72.24 
 
 		 237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  62.24 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  53.68 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  58.97 
 
 		 1698 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  41.89 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  54.55 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  48.86 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  55.95 
 
 		 207 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  49 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  62.86 
 
 		 371 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  51.61 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  51.49 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  40.46 
 
 		 275 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  38.96 
 
 		 322 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  56.79 
 
 		 332 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  56.79 
 
 		 363 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  39.39 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  50.59 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  57.14 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  46.94 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  38 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  51.19 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  54.32 
 
 		 359 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  32.19 
 
 		 348 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  67.74 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  62.9 
 
 		 401 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  50.54 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  48.86 
 
 		 378 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  51.72 
 
 		 380 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  53.26 
 
 		 1578 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  47.22 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  49.45 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  54.55 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  54.88 
 
 		 308 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  45.63 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  50.52 
 
 		 1682 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  48.42 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  50.53 
 
 		 982 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  56.16 
 
 		 376 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  53.16 
 
 		 352 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1632 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  48.89 
 
 		 1669 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  39.47 
 
 		 344 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  53.66 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  53.75 
 
 		 1562 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  48.15 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  57.35 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  53.16 
 
 		 1689 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  52.05 
 
 		 1559 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  40.77 
 
 		 1723 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  44.21 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  49.37 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  42.86 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  49.37 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  41.07 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  46.59 
 
 		 1658 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  37.5 
 
 		 2277 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  30.33 
 
 		 869 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1840 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1352 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  44.9 
 
 		 956 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  30.26 
 
 		 335 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  32.43 
 
 		 451 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  40.35 
 
 		 690 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.68 
 
 		 1381 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  45.83 
 
 		 1568 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1433 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  35 
 
 		 520 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>