90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0351 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0353  hypothetical protein  57.95 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0343  hypothetical protein  55.06 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0352  hypothetical protein  50.56 
 
 		 314 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.085325  normal  0.352032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3160  hypothetical protein  56.79 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164631  normal  0.454701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4877  hypothetical protein  57.14 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2044  YD repeat-containing protein  59.04 
 
 		 1578 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.699385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0342  hypothetical protein  73.02 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5194  hypothetical protein  69.23 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1558  hypothetical protein  56.47 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175001  normal  0.301073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4871  hypothetical protein  57.32 
 
 		 363 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0201  hypothetical protein  51.52 
 
 		 317 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3687  hypothetical protein  46.67 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4723  hypothetical protein  53.49 
 
 		 352 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3628  hypothetical protein  55.95 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0355  hypothetical protein  53.09 
 
 		 316 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0329  hypothetical protein  50.56 
 
 		 307 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4870  hypothetical protein  46.36 
 
 		 359 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1782  hypothetical protein  53.49 
 
 		 378 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0454  hypothetical protein  56.79 
 
 		 332 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4242  hypothetical protein  51.69 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.834895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4720  hypothetical protein  47.79 
 
 		 338 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1514  hypothetical protein  39.84 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2793  YD repeat-containing protein  48.98 
 
 		 1698 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4303  hypothetical protein  38 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.776134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5312  hypothetical protein  50.52 
 
 		 380 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4027  hypothetical protein  48.35 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  51.19 
 
 		 1682 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2239  YD repeat protein  53.09 
 
 		 1562 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  55 
 
 		 982 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4878  hypothetical protein  41.18 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.693659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4719  hypothetical protein  58.75 
 
 		 348 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2253  hypothetical protein  44.83 
 
 		 344 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  63.08 
 
 		 401 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3469  hypothetical protein  45.19 
 
 		 322 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.666556  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01747  hypothetical protein  46.88 
 
 		 376 aa  88.6  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3868  hypothetical protein  47.19 
 
 		 122 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2062  hypothetical protein  44.55 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.797532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  51.81 
 
 		 1632 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3471  hypothetical protein  49.4 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1811  hypothetical protein  46.53 
 
 		 303 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0954241  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2466  hypothetical protein  45.63 
 
 		 295 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1780  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  50.6 
 
 		 1669 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4022  hypothetical protein  45.19 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.960579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4929  hypothetical protein  60.32 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0337  hypothetical protein  50.62 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0335  hypothetical protein  62.3 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000359835  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0331  hypothetical protein  46.91 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414907  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4893  hypothetical protein  50.67 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000184747  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0338  hypothetical protein  47.56 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0399625  normal  0.840977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  48.81 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2244  hypothetical protein  46.25 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01674  hypothetical protein  55.38 
 
 		 1559 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  51.25 
 
 		 1723 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  48.1 
 
 		 1658 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  55.56 
 
 		 1689 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  35.51 
 
 		 869 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  42.86 
 
 		 1732 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  41.76 
 
 		 2542 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1917 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  45.16 
 
 		 1623 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  43.08 
 
 		 2658 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  44.12 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1840 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  35.29 
 
 		 2277 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1942 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 1433 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  41.54 
 
 		 2349 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1600 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  37.18 
 
 		 989 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  36.92 
 
 		 2942 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 605 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  40.98 
 
 		 2698 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1959 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  41.43 
 
 		 765 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  36.47 
 
 		 690 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1834 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  39.34 
 
 		 1791 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  37.65 
 
 		 927 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  30.68 
 
 		 738 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 3073 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  38.1 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  34.78 
 
 		 1710 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  35.8 
 
 		 451 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1352 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2145 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  46.55 
 
 		 628 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0792  YD repeat protein  43.64 
 
 		 712 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  42.42 
 
 		 474 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>