More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1682 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 474 aa  955    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  96.77 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  68.78 
 
 		 554 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  32.44 
 
 		 2138 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  39.92 
 
 		 1834 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  40.17 
 
 		 2017 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  35.97 
 
 		 628 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  34.6 
 
 		 2428 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  33.46 
 
 		 2416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1854 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1517 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  31.84 
 
 		 2513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  56.12 
 
 		 232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  33.2 
 
 		 1271 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.38 
 
 		 2096 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  32.2 
 
 		 2076 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  37.56 
 
 		 1976 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2762 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  34.3 
 
 		 1381 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 		 2374 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  28.72 
 
 		 2413 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  40.54 
 
 		 2494 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  29.89 
 
 		 2145 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  28.93 
 
 		 2497 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  30.57 
 
 		 1732 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  30.89 
 
 		 2658 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 		 2286 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  28.87 
 
 		 722 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  30.57 
 
 		 765 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  28.24 
 
 		 2437 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  31.09 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.21 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.96 
 
 		 2094 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  37.68 
 
 		 2075 aa  97.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  30.03 
 
 		 2401 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  32.33 
 
 		 1140 aa  97.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  31.18 
 
 		 2225 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  30.89 
 
 		 2224 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  34.51 
 
 		 3073 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  29.84 
 
 		 2246 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  30.27 
 
 		 2224 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  30.12 
 
 		 678 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  30.27 
 
 		 2224 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1008 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  33.33 
 
 		 1008 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  29.24 
 
 		 2178 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 		 2942 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  31.7 
 
 		 1600 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  29.81 
 
 		 2221 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  30.77 
 
 		 2349 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  31.23 
 
 		 927 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  28.62 
 
 		 3456 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  33.47 
 
 		 1345 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  33.47 
 
 		 1345 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  35.51 
 
 		 2165 aa  90.9  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1147 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  30.39 
 
 		 2283 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 3333 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1942 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  30.58 
 
 		 927 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  30.34 
 
 		 2149 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  45.63 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  31.33 
 
 		 2290 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1172 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  29.85 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 2448 aa  87.4  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1959 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  30.74 
 
 		 765 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  31.97 
 
 		 2003 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1157 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1433 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 622 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  42.97 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  32.43 
 
 		 1628 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  33.71 
 
 		 1081 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1352 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  30.52 
 
 		 1599 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  32.33 
 
 		 1953 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  31.25 
 
 		 2007 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  40.68 
 
 		 2035 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  41.38 
 
 		 2059 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  36.09 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  30.14 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  28.84 
 
 		 1917 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 955 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  30.38 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1558 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  41.67 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 2035 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 2032 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 920 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.54 
 
 		 1586 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.54 
 
 		 1595 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  44.74 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  42.06 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  42.06 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  42.06 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 2402 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>