More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4251 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1628 aa  3299    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1834 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.08 
 
 		 2138 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.16 
 
 		 1467 aa  138  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1433 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 605 aa  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.35 
 
 		 1271 aa  112  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.89 
 
 		 2094 aa  109  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.23 
 
 		 927 aa  108  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.11 
 
 		 2096 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.22 
 
 		 1381 aa  105  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.87 
 
 		 741 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  24.49 
 
 		 2117 aa  103  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 690 aa  102  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 913 aa  102  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.77 
 
 		 788 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.5 
 
 		 764 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.77 
 
 		 788 aa  101  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1427 aa  99  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.63 
 
 		 1976 aa  99  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.45 
 
 		 903 aa  95.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1611 aa  94  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.52 
 
 		 705 aa  94.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1352 aa  94  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.64 
 
 		 738 aa  93.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1600 aa  91.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1517 aa  91.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.82 
 
 		 482 aa  91.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.04 
 
 		 2076 aa  90.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  33.08 
 
 		 474 aa  89.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1550 aa  88.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  24.14 
 
 		 1140 aa  88.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  22.95 
 
 		 2513 aa  88.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  29.03 
 
 		 628 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.48 
 
 		 1560 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.88 
 
 		 1576 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.86 
 
 		 1599 aa  85.5  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 3273 aa  85.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1527 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  26.88 
 
 		 917 aa  84.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.41 
 
 		 2413 aa  84  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.95 
 
 		 889 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  23.29 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1198 aa  81.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1959 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 2401 aa  79.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1547 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  22.22 
 
 		 3333 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  25.82 
 
 		 2035 aa  78.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  40.38 
 
 		 299 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.31 
 
 		 2731 aa  77  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  28.57 
 
 		 1998 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1935 aa  77  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  26.16 
 
 		 920 aa  77  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.55 
 
 		 2149 aa  77  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 2437 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1551 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  29.56 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 869 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24 
 
 		 1485 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.86 
 
 		 1586 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.86 
 
 		 1595 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 2286 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 3193 aa  75.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 		 2942 aa  74.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.39 
 
 		 1577 aa  73.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.73 
 
 		 2277 aa  73.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.53 
 
 		 2145 aa  73.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  24.21 
 
 		 2194 aa  73.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1520 aa  73.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.23 
 
 		 2032 aa  72.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  30.04 
 
 		 1053 aa  72  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  23.58 
 
 		 1464 aa  72  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 972 aa  71.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 939 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 3073 aa  70.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1558 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 2615 aa  70.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  24.62 
 
 		 2290 aa  70.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1763 aa  70.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  27.23 
 
 		 468 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  20.96 
 
 		 2035 aa  70.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  28.44 
 
 		 902 aa  70.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.5 
 
 		 1953 aa  69.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1942 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  23.27 
 
 		 2428 aa  69.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  37.88 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.13 
 
 		 3027 aa  69.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.6 
 
 		 1917 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 909 aa  67.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  28.33 
 
 		 1681 aa  68.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  34.59 
 
 		 520 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.99 
 
 		 1840 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1090 aa  68.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.27 
 
 		 1008 aa  67.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  23.8 
 
 		 893 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  23.68 
 
 		 722 aa  67.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1411 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>