More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2323 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1125    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  69.52 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  78.92 
 
 		 474 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2075  hypothetical protein  69.63 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.206624  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  37.56 
 
 		 2138 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1568  hypothetical protein  50.7 
 
 		 490 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.813042  normal  0.0272159 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1834 aa  123  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  44.14 
 
 		 2017 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  48.59 
 
 		 628 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  56.12 
 
 		 232 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  45.7 
 
 		 1517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  38.65 
 
 		 2494 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  44.17 
 
 		 2428 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  34.27 
 
 		 2762 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  47.71 
 
 		 2094 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  34.86 
 
 		 2096 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  42.48 
 
 		 2075 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  47.12 
 
 		 299 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  40.83 
 
 		 2416 aa  90.9  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 2374 aa  87.4  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  35.1 
 
 		 2165 aa  87  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  38 
 
 		 1976 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  36.59 
 
 		 2497 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  39.17 
 
 		 1854 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  34.96 
 
 		 1942 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1600 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  42.59 
 
 		 302 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  36.62 
 
 		 1271 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  36.96 
 
 		 2035 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  31.54 
 
 		 2513 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 2035 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  43.52 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  40.52 
 
 		 2059 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  38.66 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  38.66 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  38.66 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  37.68 
 
 		 2149 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  43.48 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.38 
 
 		 2942 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 2437 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  41.86 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  27.31 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  35.29 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  38.05 
 
 		 1732 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  36.43 
 
 		 1959 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1917 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 2402 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 		 3333 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  36.8 
 
 		 2286 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.72 
 
 		 3027 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 6109 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  41.44 
 
 		 1352 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 765 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  31.62 
 
 		 2283 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  36 
 
 		 1140 aa  71.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  40.91 
 
 		 1338 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  30.73 
 
 		 2401 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.58 
 
 		 2290 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  33.57 
 
 		 2413 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 2448 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  33.57 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  32.59 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  31.15 
 
 		 1840 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  34.09 
 
 		 2076 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  38.4 
 
 		 3073 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  38.26 
 
 		 2615 aa  67  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  32 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  30.32 
 
 		 2554 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1147 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  37.61 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  34.65 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  32.52 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  33.99 
 
 		 1090 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  35.11 
 
 		 3320 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  33.87 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  39.32 
 
 		 1381 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  34.88 
 
 		 2225 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  35.29 
 
 		 952 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 881 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  39.66 
 
 		 1791 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  32.03 
 
 		 2145 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  35.14 
 
 		 920 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1411 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  44.05 
 
 		 2349 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  35.4 
 
 		 1053 aa  63.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  35.85 
 
 		 893 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  42.17 
 
 		 2658 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  37.88 
 
 		 1628 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1520 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  38.97 
 
 		 1770 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  30.71 
 
 		 2443 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  36.21 
 
 		 3456 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1081 aa  62  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  32.62 
 
 		 1140 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1488 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  37.84 
 
 		 2510 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  34.17 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  34.82 
 
 		 2007 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  39.29 
 
 		 1572 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>