More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4266 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  98.66 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  73.39 
 
 		 520 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  42.64 
 
 		 869 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  68.91 
 
 		 391 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  40.98 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  43.97 
 
 		 2428 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2374 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  39.01 
 
 		 722 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  38.28 
 
 		 2075 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  41.59 
 
 		 2413 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.71 
 
 		 2094 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  34.71 
 
 		 1976 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  40.78 
 
 		 1352 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.28 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  41.28 
 
 		 2494 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  38.66 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  42.06 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  37.8 
 
 		 2416 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  43.14 
 
 		 1600 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  36.67 
 
 		 2443 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1181  wall-associated protein  34.45 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  38.26 
 
 		 1834 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  32.94 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  38.02 
 
 		 678 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1854 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  38.26 
 
 		 2165 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  39.81 
 
 		 2294 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1517 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  40.95 
 
 		 2096 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  34.53 
 
 		 1573 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  35.9 
 
 		 2554 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  36.11 
 
 		 2225 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 2402 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  32.59 
 
 		 2224 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  32.59 
 
 		 2224 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.88 
 
 		 928 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  32.59 
 
 		 2224 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  33.04 
 
 		 1381 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  39.26 
 
 		 628 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  46.39 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  35.14 
 
 		 690 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  37.72 
 
 		 2534 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1278  cell wall-associated protein  35.92 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  35.65 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  34.06 
 
 		 3320 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  35.66 
 
 		 3193 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  38.32 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  35.78 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  39.09 
 
 		 2558 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.82 
 
 		 2349 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1135  wall-associated protein  35.9 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3333 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  37.61 
 
 		 2652 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1770 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  31.06 
 
 		 504 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  37.04 
 
 		 2221 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.65 
 
 		 924 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  36.19 
 
 		 927 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1025  wall-associated domain-containing protein  32.23 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  36.7 
 
 		 2658 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  38.1 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.17 
 
 		 1362 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  33.59 
 
 		 2178 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  33.05 
 
 		 1386 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  31.08 
 
 		 1550 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  31.3 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 867 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  31.94 
 
 		 1998 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  36.36 
 
 		 980 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  36.46 
 
 		 1840 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  35.65 
 
 		 1568 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  32.48 
 
 		 3456 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1528 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  44.29 
 
 		 6109 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  36.11 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  42.47 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  36.94 
 
 		 886 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  31.45 
 
 		 1338 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  29.71 
 
 		 2059 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  35.65 
 
 		 2510 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1410 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  33.04 
 
 		 2149 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  34.58 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  35.4 
 
 		 955 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  34.75 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1917 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  43.04 
 
 		 2017 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 866 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1126 aa  62.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1488 aa  62.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  38.89 
 
 		 2843 aa  62.8  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  41.77 
 
 		 2138 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1531 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  34.19 
 
 		 2246 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  33.04 
 
 		 1609 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  31.43 
 
 		 1732 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>