289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3077 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  620  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  36.97 
 
 
1517 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  47.12 
 
 
482 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  40.48 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  47.12 
 
 
554 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  48.57 
 
 
628 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  38.73 
 
 
520 aa  89.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  45.63 
 
 
474 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  41.51 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  28.28 
 
 
2149 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  38.41 
 
 
678 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  34.75 
 
 
1427 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  40.38 
 
 
1628 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  40 
 
 
2494 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  39.82 
 
 
2428 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  45.05 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  32.93 
 
 
2416 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  31.39 
 
 
2075 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.83 
 
 
2094 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  36.15 
 
 
1834 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  37.86 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  37.86 
 
 
1732 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  30.43 
 
 
2413 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  38.61 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  37.04 
 
 
1976 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  39.82 
 
 
1352 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  31.03 
 
 
1854 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  39.58 
 
 
1464 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  30.43 
 
 
722 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  30.07 
 
 
2165 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 
561 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.08 
 
 
690 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  38.83 
 
 
1600 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  30.06 
 
 
2762 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  36.89 
 
 
1959 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  38.68 
 
 
1090 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 
927 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  29.05 
 
 
1681 aa  63.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  33.6 
 
 
1271 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  28 
 
 
2138 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  33.59 
 
 
1942 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  38.64 
 
 
2349 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
1405 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 
1840 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  29.61 
 
 
171 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  32.46 
 
 
2096 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  37.5 
 
 
1998 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  32.85 
 
 
2658 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  33.8 
 
 
2294 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  37.14 
 
 
2942 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  35.78 
 
 
1917 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  32.59 
 
 
2225 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  31.86 
 
 
869 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  36.25 
 
 
867 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.96 
 
 
2554 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  29.45 
 
 
3320 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  34.55 
 
 
2286 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  35.77 
 
 
1611 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35 
 
 
1400 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  32.14 
 
 
1488 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.23 
 
 
1568 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.48 
 
 
2277 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 
1409 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  34.26 
 
 
480 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 
1081 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  32.69 
 
 
1385 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 
1386 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  29.6 
 
 
2558 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  44.59 
 
 
2017 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  40.18 
 
 
1008 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 
866 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  40.18 
 
 
1008 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  27.91 
 
 
2497 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.05 
 
 
1338 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  37.5 
 
 
2350 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  41 
 
 
2387 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 
1411 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  29.59 
 
 
1140 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  36.89 
 
 
1073 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  34.58 
 
 
2374 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  36.52 
 
 
2076 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  36.79 
 
 
1599 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  33.04 
 
 
2059 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  30.98 
 
 
1359 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  35.29 
 
 
1381 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  37.39 
 
 
1149 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  37.17 
 
 
1053 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  33.03 
 
 
2035 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  34.23 
 
 
1172 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  30.67 
 
 
1126 aa  55.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  34.68 
 
 
2003 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  34.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  35.51 
 
 
1892 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  37.36 
 
 
2194 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  31.4 
 
 
3456 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.72 
 
 
3333 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>