More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02052 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  100 
 
 		 1854 aa  3851    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  31.59 
 
 		 2428 aa  459  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  30.95 
 
 		 2416 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 2497 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  35.07 
 
 		 2762 aa  172  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  34.14 
 
 		 2513 aa  169  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.55 
 
 		 1467 aa  146  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 2401 aa  141  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.15 
 
 		 3333 aa  138  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 622 aa  136  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 2437 aa  135  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  28.4 
 
 		 2448 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 2283 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  28.61 
 
 		 2413 aa  133  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  28.02 
 
 		 722 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.58 
 
 		 482 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  33.71 
 
 		 474 aa  126  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1834 aa  125  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 2402 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  29.66 
 
 		 2165 aa  122  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  32.18 
 
 		 2075 aa  117  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.3 
 
 		 628 aa  108  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2017 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.72 
 
 		 3027 aa  100  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.36 
 
 		 2094 aa  100  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.13 
 
 		 2117 aa  99.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1517 aa  95.9  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.73 
 
 		 2096 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2277 aa  94.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 2035 aa  92  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.58 
 
 		 1271 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.94 
 
 		 903 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.81 
 
 		 2138 aa  84.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 2286 aa  84.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.54 
 
 		 1560 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 2494 aa  83.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1600 aa  83.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  28.23 
 
 		 2149 aa  82.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  39.17 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  41.46 
 
 		 391 aa  82  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 2007 aa  81.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.23 
 
 		 1543 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1552 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.21 
 
 		 2076 aa  80.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  65.38 
 
 		 340 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  28.09 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1611 aa  79.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  28.32 
 
 		 2145 aa  79  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.06 
 
 		 1140 aa  78.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  40 
 
 		 520 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.59 
 
 		 889 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1520 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.47 
 
 		 1593 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1550 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  39.32 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.98 
 
 		 738 aa  73.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.65 
 
 		 1518 aa  73.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  39.32 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  39.32 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1352 aa  73.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1547 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1551 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.38 
 
 		 1379 aa  72.4  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 3273 aa  72  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1197 aa  71.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 927 aa  72  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  25.66 
 
 		 583 aa  72  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1081 aa  71.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 598 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1669 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.09 
 
 		 1381 aa  71.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.14 
 
 		 1595 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  27.35 
 
 		 3456 aa  71.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1126 aa  70.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  26.05 
 
 		 2652 aa  70.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.14 
 
 		 1586 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  27 
 
 		 1539 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1959 aa  70.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1485 aa  70.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1487 aa  70.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.5 
 
 		 1614 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.37 
 
 		 1517 aa  69.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  47.69 
 
 		 232 aa  69.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.75 
 
 		 1539 aa  68.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.55 
 
 		 2731 aa  68.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1527 aa  68.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  36 
 
 		 2059 aa  68.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.87 
 
 		 2225 aa  68.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  36.8 
 
 		 2035 aa  68.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 3689 aa  68.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1494 aa  68.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1840 aa  67.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1429 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  35.54 
 
 		 311 aa  67.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1495 aa  67  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.08 
 
 		 1568 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  27 
 
 		 1073 aa  66.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.26 
 
 		 1494 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1494 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>