287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07080 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  37.35 
 
 		 2416 aa  1418    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  100 
 
 		 2428 aa  5035    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  31.59 
 
 		 1854 aa  459  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  31.41 
 
 		 2762 aa  261  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  32.61 
 
 		 722 aa  244  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  31.8 
 
 		 2513 aa  240  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  31.01 
 
 		 2497 aa  234  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  32.46 
 
 		 2413 aa  183  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1834 aa  160  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.6 
 
 		 482 aa  149  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.48 
 
 		 3333 aa  149  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  34.6 
 
 		 474 aa  146  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.54 
 
 		 2094 aa  143  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.55 
 
 		 628 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  28.25 
 
 		 2165 aa  124  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 2283 aa  122  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 2448 aa  122  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 2437 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2017 aa  120  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  40.44 
 
 		 2075 aa  118  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 2401 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 622 aa  117  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  27.45 
 
 		 2402 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1517 aa  114  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.02 
 
 		 1271 aa  109  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2117 aa  107  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  40.36 
 
 		 2494 aa  105  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  44.17 
 
 		 554 aa  101  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 2032 aa  96.3  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  39.71 
 
 		 391 aa  92  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  28.23 
 
 		 2510 aa  90.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  28.98 
 
 		 2286 aa  88.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  23.41 
 
 		 2031 aa  86.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  31.28 
 
 		 2138 aa  85.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  39.52 
 
 		 520 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  43.97 
 
 		 298 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  43.97 
 
 		 298 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  43.97 
 
 		 316 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.18 
 
 		 2031 aa  84  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  58.06 
 
 		 232 aa  81.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  22.79 
 
 		 2731 aa  81.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.12 
 
 		 2076 aa  81.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.91 
 
 		 2145 aa  80.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.57 
 
 		 1825 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.57 
 
 		 1806 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2096 aa  80.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  21.57 
 
 		 1825 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 3193 aa  79.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1352 aa  78.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1600 aa  77.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.15 
 
 		 678 aa  77.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  23.14 
 
 		 2035 aa  76.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  29.24 
 
 		 1381 aa  75.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  23.77 
 
 		 2059 aa  73.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.35 
 
 		 1008 aa  73.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.35 
 
 		 1008 aa  73.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 2007 aa  73.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.06 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.27 
 
 		 2349 aa  73.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  39.82 
 
 		 299 aa  73.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  27.79 
 
 		 2290 aa  73.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1140 aa  72.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1959 aa  72  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.18 
 
 		 2031 aa  72.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1732 aa  71.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  31.44 
 
 		 2194 aa  71.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  57.14 
 
 		 340 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.96 
 
 		 1345 aa  71.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.96 
 
 		 1345 aa  71.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1126 aa  70.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1942 aa  70.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.59 
 
 		 1976 aa  70.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.76 
 
 		 2221 aa  69.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  24.93 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 2942 aa  69.3  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 3320 aa  69.3  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.42 
 
 		 2246 aa  68.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.39 
 
 		 2224 aa  68.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 956 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  28 
 
 		 2178 aa  68.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.11 
 
 		 2658 aa  68.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.39 
 
 		 2224 aa  68.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 2374 aa  68.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.39 
 
 		 2224 aa  68.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  21.84 
 
 		 1467 aa  68.6  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  27.76 
 
 		 765 aa  68.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 		 3073 aa  67.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  27.16 
 
 		 311 aa  68.6  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.94 
 
 		 2225 aa  67.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.32 
 
 		 3456 aa  67.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1628 aa  67.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1917 aa  67.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  22.75 
 
 		 2443 aa  67  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1433 aa  67  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1595 aa  66.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  22.42 
 
 		 1568 aa  67  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 605 aa  67  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  24.5 
 
 		 1485 aa  66.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1840 aa  66.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  20.34 
 
 		 1434 aa  65.9  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>