255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3660 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  37.75 
 
 		 2145 aa  1014    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  36.19 
 
 		 2076 aa  970    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  34.57 
 
 		 2194 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  32.02 
 
 		 2191 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  37.6 
 
 		 2290 aa  979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  39.3 
 
 		 2286 aa  988    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2007 aa  4066    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  31.5 
 
 		 2615 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  40.49 
 
 		 1140 aa  496  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  31.89 
 
 		 2542 aa  329  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1834 aa  194  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2017 aa  164  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2117 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 3333 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.71 
 
 		 2094 aa  120  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.53 
 
 		 2138 aa  109  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 2448 aa  102  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 927 aa  102  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.97 
 
 		 2513 aa  100  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 2401 aa  99.8  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1600 aa  97.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.75 
 
 		 1976 aa  98.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 2437 aa  97.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.38 
 
 		 2497 aa  96.3  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.03 
 
 		 1271 aa  95.9  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1352 aa  95.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.09 
 
 		 2096 aa  94.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 2283 aa  92.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 690 aa  88.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 2374 aa  87.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2149 aa  86.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.25 
 
 		 482 aa  85.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1882  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1632 aa  83.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517135  normal  0.564659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  30.6 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  31.25 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  27.64 
 
 		 2059 aa  82.4  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1433 aa  81.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1942 aa  82  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1854 aa  81.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  23.24 
 
 		 3456 aa  80.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1917 aa  80.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.4 
 
 		 2035 aa  80.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.27 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 2035 aa  79.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 3073 aa  79  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.63 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1669 aa  78.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1517 aa  77  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1840 aa  77  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  24.36 
 
 		 2534 aa  76.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 2032 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  25.19 
 
 		 2428 aa  75.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.81 
 
 		 1381 aa  76.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.7 
 
 		 1467 aa  75.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1577 aa  75.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 2003 aa  74.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.2 
 
 		 738 aa  73.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.74 
 
 		 678 aa  71.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.93 
 
 		 2731 aa  70.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1959 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  32.71 
 
 		 1008 aa  70.1  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  32.71 
 
 		 1008 aa  70.1  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 2294 aa  69.3  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.68 
 
 		 1485 aa  69.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 2942 aa  68.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  26.79 
 
 		 890 aa  67.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 3689 aa  67  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  31.78 
 
 		 1345 aa  67  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  31.78 
 
 		 1345 aa  67  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  24.36 
 
 		 2031 aa  67  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.43 
 
 		 1681 aa  66.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 2031 aa  65.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.18 
 
 		 3027 aa  65.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  26.16 
 
 		 1073 aa  65.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 2031 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.09 
 
 		 1576 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  26.42 
 
 		 2443 aa  64.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 3193 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  42.65 
 
 		 2413 aa  63.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.38 
 
 		 1953 aa  63.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  26.07 
 
 		 2416 aa  62.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.58 
 
 		 2277 aa  62.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 869 aa  62.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1620 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1763 aa  62.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  43.28 
 
 		 722 aa  61.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 622 aa  62  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 913 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  41.11 
 
 		 2494 aa  61.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  34.82 
 
 		 554 aa  61.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 2402 aa  60.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  26.05 
 
 		 1879 aa  60.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 956 aa  59.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  28.62 
 
 		 2350 aa  58.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1319 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1046 aa  58.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  24.25 
 
 		 1427 aa  58.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1147 aa  58.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>