287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1054 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  40.69 
 
 		 2145 aa  1153    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  36.42 
 
 		 2615 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  40.72 
 
 		 2076 aa  1216    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  41.47 
 
 		 2290 aa  1238    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  36.5 
 
 		 2194 aa  877    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2286 aa  4640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  39.04 
 
 		 2007 aa  1022    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  32.67 
 
 		 2542 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  35.42 
 
 		 2191 aa  854    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  36.99 
 
 		 1140 aa  555  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1834 aa  197  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.05 
 
 		 2094 aa  157  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.95 
 
 		 2138 aa  155  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.56 
 
 		 2017 aa  144  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.24 
 
 		 2117 aa  142  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 3073 aa  137  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.48 
 
 		 3456 aa  130  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  25.2 
 
 		 2497 aa  128  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  23.98 
 
 		 2513 aa  126  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.87 
 
 		 1976 aa  123  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 3333 aa  122  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 2283 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  42.01 
 
 		 3273 aa  113  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  45.24 
 
 		 614 aa  112  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 2437 aa  108  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 2401 aa  108  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 927 aa  107  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.92 
 
 		 482 aa  106  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.45 
 
 		 2762 aa  103  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.1 
 
 		 2096 aa  103  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 2402 aa  103  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 		 474 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.89 
 
 		 1271 aa  100  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 2448 aa  98.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  49.57 
 
 		 238 aa  95.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.66 
 
 		 741 aa  94  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 690 aa  94  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.39 
 
 		 889 aa  93.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1467 aa  93.2  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1517 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.43 
 
 		 903 aa  92.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.6 
 
 		 1953 aa  90.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1600 aa  91.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.98 
 
 		 3027 aa  90.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.98 
 
 		 738 aa  90.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  28.98 
 
 		 2428 aa  90.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.6 
 
 		 1577 aa  90.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.54 
 
 		 2035 aa  89.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.18 
 
 		 917 aa  88.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.69 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.69 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  38.56 
 
 		 2585 aa  86.7  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.12 
 
 		 1485 aa  86.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1854 aa  86.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 2032 aa  86.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 		 1391 aa  85.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.24 
 
 		 1427 aa  84.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.09 
 
 		 920 aa  82.4  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.41 
 
 		 2731 aa  82  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  21.96 
 
 		 1384 aa  80.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 628 aa  80.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  31.46 
 
 		 2374 aa  79.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 2031 aa  79.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1433 aa  79.7  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.69 
 
 		 678 aa  79.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  29.74 
 
 		 1053 aa  79.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25.76 
 
 		 764 aa  79  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  24.85 
 
 		 2035 aa  77  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.85 
 
 		 2059 aa  77.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  24.31 
 
 		 2031 aa  77.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  28.35 
 
 		 2443 aa  76.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  35.1 
 
 		 2494 aa  76.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 		 1559 aa  76.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1081 aa  76.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  33.1 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.59 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  21.61 
 
 		 2413 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  23.24 
 
 		 2698 aa  74.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  37.01 
 
 		 554 aa  73.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  25.21 
 
 		 2416 aa  73.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.86 
 
 		 2277 aa  73.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  39.01 
 
 		 2486 aa  73.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  37.32 
 
 		 251 aa  73.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  36.73 
 
 		 613 aa  73.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.26 
 
 		 2149 aa  72.8  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1301 aa  72.8  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.85 
 
 		 2417 aa  72.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  36.73 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  39.19 
 
 		 566 aa  72  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.9 
 
 		 2510 aa  72  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  36.3 
 
 		 846 aa  72  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  38.1 
 
 		 471 aa  72  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 2031 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1628 aa  71.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1390 aa  71.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  23.41 
 
 		 840 aa  70.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  29.64 
 
 		 2294 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 622 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  35.1 
 
 		 333 aa  70.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  35.37 
 
 		 450 aa  70.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>