57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2838 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1238    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  95.08 
 
 		 450 aa  784    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  90.02 
 
 		 471 aa  787    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  85.53 
 
 		 615 aa  988    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  93.74 
 
 		 558 aa  769    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  86.67 
 
 		 615 aa  996    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  87.5 
 
 		 566 aa  758    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  86.5 
 
 		 615 aa  991    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  95.3 
 
 		 561 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  91.75 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  86.79 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  91.82 
 
 		 333 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  87 
 
 		 334 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  96 
 
 		 202 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  81.08 
 
 		 268 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  84.89 
 
 		 251 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  96.18 
 
 		 212 aa  220  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1198  hypothetical protein  82.05 
 
 		 117 aa  203  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000623661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2840  hypothetical protein  83.04 
 
 		 114 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00994271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2210  putative cytoplasmic protein  56.89 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  unclonable  1.13834e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1195  hypothetical protein  81.82 
 
 		 114 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2794  hypothetical protein  55.69 
 
 		 545 aa  183  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3036  putative cytoplasmic protein  55.15 
 
 		 135 aa  140  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  64.21 
 
 		 209 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  39.58 
 
 		 716 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  39.58 
 
 		 1559 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  27.84 
 
 		 581 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  27.91 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  40.44 
 
 		 701 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  28.81 
 
 		 574 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2212  putative cytoplasmic protein  38.67 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000235333  hitchhiker  2.3052800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  31.25 
 
 		 1568 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  36.73 
 
 		 2286 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  35.07 
 
 		 2486 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.55 
 
 		 6274 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  32.89 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  38.19 
 
 		 2585 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  36.99 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  32.35 
 
 		 3073 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2789  hypothetical protein  46.23 
 
 		 112 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000416361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  34.46 
 
 		 3689 aa  68.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2787  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000546182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  34.62 
 
 		 997 aa  60.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 1391 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  28.37 
 
 		 2387 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  30.19 
 
 		 2615 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  30.32 
 
 		 848 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  28.66 
 
 		 1140 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.19 
 
 		 2290 aa  54.3  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 		 2296 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  30.52 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 3273 aa  50.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  40.24 
 
 		 2094 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  24.24 
 
 		 1345 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4048  hypothetical protein  29.03 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  23.49 
 
 		 2428 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1154  protein of unknown function DUF456  41.76 
 
 		 169 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.147435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>