45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1926 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  819    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  88.52 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  91.21 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  75.57 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  89.9 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  89.35 
 
 		 615 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  89.35 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  88.89 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  88.06 
 
 		 615 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  86.79 
 
 		 613 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  84.91 
 
 		 471 aa  461  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  80.5 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  91.58 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  68.95 
 
 		 268 aa  345  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  88.65 
 
 		 251 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  88.89 
 
 		 212 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  71.23 
 
 		 209 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  40.15 
 
 		 701 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  35.33 
 
 		 716 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 1559 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  30.27 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  30.27 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  30.27 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  30.97 
 
 		 3073 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.8 
 
 		 1568 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  30.5 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.41 
 
 		 2585 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  36.05 
 
 		 2286 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.89 
 
 		 6274 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  34.93 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  32.21 
 
 		 3689 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  87.93 
 
 		 202 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 2486 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  35.87 
 
 		 997 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  29.31 
 
 		 1140 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 		 2615 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.43 
 
 		 2290 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 1391 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.53 
 
 		 2296 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  29.55 
 
 		 2387 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  32.24 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 3273 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.59 
 
 		 2094 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  27.97 
 
 		 1345 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  28.44 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>