36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0439 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 
701 aa  1440    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0442  hypothetical protein  66.42 
 
 
264 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000473373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0445  hypothetical protein  77.78 
 
 
113 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  43.07 
 
 
558 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  36.6 
 
 
333 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  36.67 
 
 
334 aa  98.2  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  42.34 
 
 
401 aa  98.2  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  42.34 
 
 
561 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  41.61 
 
 
566 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  41.61 
 
 
615 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  42.55 
 
 
251 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  41.61 
 
 
615 aa  94.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  40.15 
 
 
408 aa  94  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  41.61 
 
 
615 aa  94  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  90.9  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  40.15 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  40.15 
 
 
268 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  35.48 
 
 
613 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  28.05 
 
 
716 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  35.46 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  33.78 
 
 
1559 aa  76.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.93 
 
 
1568 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 
2486 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  32.9 
 
 
3689 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  31.25 
 
 
3073 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  26.23 
 
 
2585 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  27.95 
 
 
575 aa  57  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  28.37 
 
 
574 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  27.95 
 
 
581 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  30.07 
 
 
2290 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  27.63 
 
 
6274 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 
2615 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  26 
 
 
715 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  26 
 
 
715 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3738  hypothetical protein  28.69 
 
 
544 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  23.15 
 
 
400 aa  45.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>