34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2933 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 		 400 aa  801    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  83.95 
 
 		 1953 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  46.11 
 
 		 2615 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  44.87 
 
 		 3273 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  42.39 
 
 		 1140 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  36.06 
 
 		 2585 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  38.01 
 
 		 2290 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 1391 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  38.98 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  28.17 
 
 		 716 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  28.65 
 
 		 1559 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  43.48 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  29.05 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  33.99 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  32.1 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  34.31 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  34.38 
 
 		 2542 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  35.04 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  31.65 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  32.68 
 
 		 615 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  32.47 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  32.45 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  30.52 
 
 		 613 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  33.58 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  32.12 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  32.62 
 
 		 2286 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  35.29 
 
 		 846 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  28.85 
 
 		 3689 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  23.16 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  31.91 
 
 		 6274 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.01 
 
 		 2296 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>