59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2047 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  87.5 
 
 		 613 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  87.47 
 
 		 450 aa  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  82.4 
 
 		 615 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  83.02 
 
 		 615 aa  732    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  80.04 
 
 		 558 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1145    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  84.06 
 
 		 615 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  88.27 
 
 		 561 aa  742    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  90 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  89.87 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  88.52 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  71.13 
 
 		 333 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  80.97 
 
 		 334 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  85.5 
 
 		 202 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  88.89 
 
 		 251 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  88.57 
 
 		 268 aa  257  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1198  hypothetical protein  88.03 
 
 		 117 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000623661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  87.79 
 
 		 212 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  40.7 
 
 		 3073 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  72.46 
 
 		 209 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  41.61 
 
 		 701 aa  97.1  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  38.97 
 
 		 1559 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  38.97 
 
 		 716 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  30.92 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  30.92 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  31.62 
 
 		 581 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3685  hypothetical protein  45.05 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761425  normal  0.0171631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.01 
 
 		 2585 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  39.19 
 
 		 2286 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.17 
 
 		 1568 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  32.24 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 2486 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  36.3 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.76 
 
 		 6274 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0187  hypothetical protein  32.79 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0919  hypothetical protein  35.24 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.326782  hitchhiker  0.00866489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 1391 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  32.28 
 
 		 2615 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  30.68 
 
 		 3689 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.88 
 
 		 2290 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 3273 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  28.95 
 
 		 1140 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  31.48 
 
 		 2387 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  34.07 
 
 		 997 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 		 2296 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  33.58 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2542 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  38.71 
 
 		 1423 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  35.35 
 
 		 846 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  25.19 
 
 		 1345 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  40.26 
 
 		 2094 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3062  hypothetical protein  27.12 
 
 		 248 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00911148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1825 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1825 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1806 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1154  protein of unknown function DUF456  43.96 
 
 		 169 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.147435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  26.74 
 
 		 2428 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  28.44 
 
 		 426 aa  43.9  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  30.19 
 
 		 1953 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>