17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3685 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3685  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1238    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761425  normal  0.0171631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3687  hypothetical protein  83.26 
 
 		 394 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  49.41 
 
 		 3073 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  45.05 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3328  hypothetical protein  63.16 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.087084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  43.96 
 
 		 1423 aa  60.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0240  hypothetical protein  52.94 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.15361e-84 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  37.23 
 
 		 231 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2979  hypothetical protein  50.98 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0195  hypothetical protein  33.94 
 
 		 410 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000000000729506  decreased coverage  1.10644e-48 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0226  hypothetical protein  33.94 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2991  hypothetical protein  33.98 
 
 		 410 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000504887  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0190  hypothetical protein  54.05 
 
 		 410 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000036563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2541  aminoacyl-tRNA synthetase class I  38.89 
 
 		 263 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1949  putative cytoplasmic protein  34.91 
 
 		 131 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.104147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.326782  hitchhiker  0.00866489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1494  hypothetical protein  34.04 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>