40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 1391 aa  2721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3878  protein of unknown function DUF312  57.01 
 
 		 1211 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.53376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  59.69 
 
 		 1528 aa  142  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  53.42 
 
 		 2615 aa  139  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3343  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1426 aa  131  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  unclonable  0.00184093  hitchhiker  0.000724597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3116  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1375 aa  126  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.176624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  43.86 
 
 		 1140 aa  125  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  51.7 
 
 		 3273 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  30.58 
 
 		 2290 aa  122  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  47.27 
 
 		 614 aa  110  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1253  protein of unknown function DUF312  43 
 
 		 1247 aa  104  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.256506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  44.72 
 
 		 2286 aa  99.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  39.52 
 
 		 2585 aa  99.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  51.92 
 
 		 238 aa  95.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 1040 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  38.41 
 
 		 2542 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  41.38 
 
 		 846 aa  84.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  42.24 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  43.75 
 
 		 1953 aa  82  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  34 
 
 		 615 aa  71.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  35.14 
 
 		 566 aa  70.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3560  protein of unknown function DUF312  33.77 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  32.86 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  30.97 
 
 		 561 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  32.6 
 
 		 558 aa  67  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  32.55 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  35 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  33.33 
 
 		 1568 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  33.02 
 
 		 471 aa  63.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  34.64 
 
 		 3073 aa  63.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  31.37 
 
 		 1559 aa  62  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  30.97 
 
 		 716 aa  62  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  34.43 
 
 		 450 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  31.25 
 
 		 333 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  31.41 
 
 		 334 aa  55.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  31.41 
 
 		 401 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.09 
 
 		 668 aa  45.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  31.18 
 
 		 762 aa  45.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 		 657 aa  45.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>