46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1928 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  71.43 
 
 		 566 aa  424  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  93.21 
 
 		 615 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  94.04 
 
 		 450 aa  417  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  91.59 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  90.79 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  91.93 
 
 		 615 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  91.48 
 
 		 615 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  91.82 
 
 		 613 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  89.33 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  89.45 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  80.75 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  85.99 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  86.52 
 
 		 268 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  85.03 
 
 		 251 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  91.67 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  78.26 
 
 		 209 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  38.97 
 
 		 1559 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  38.97 
 
 		 716 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  36.6 
 
 		 701 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  32.73 
 
 		 575 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  32.73 
 
 		 574 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  32.73 
 
 		 581 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  29.95 
 
 		 3073 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.7 
 
 		 1568 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  32.34 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  35.1 
 
 		 2286 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  34.67 
 
 		 3689 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 2486 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  36.55 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  30.25 
 
 		 997 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  35.37 
 
 		 2585 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 2615 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  32.32 
 
 		 6274 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  29.05 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.48 
 
 		 2290 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  30.26 
 
 		 1140 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  32.35 
 
 		 2387 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 1391 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3220  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 3273 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6262  hypothetical protein  29.92 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  28.44 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.37 
 
 		 2296 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  37.04 
 
 		 1953 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  30.53 
 
 		 2542 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>