49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1979 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  87.47 
 
 		 566 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  96.42 
 
 		 615 aa  796    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  95.75 
 
 		 558 aa  790    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  97.54 
 
 		 615 aa  805    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  95.08 
 
 		 613 aa  784    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  95.08 
 
 		 561 aa  793    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  96.2 
 
 		 615 aa  792    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  905    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  94.39 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  89.47 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  90.76 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  94.04 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  89 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  94.5 
 
 		 202 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  87.77 
 
 		 251 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  87.59 
 
 		 268 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  94.66 
 
 		 212 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1198  hypothetical protein  82.91 
 
 		 117 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000623661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  77.94 
 
 		 209 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 1559 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  36.3 
 
 		 716 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  42.14 
 
 		 701 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  31.52 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  31.52 
 
 		 574 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  31.52 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  33.82 
 
 		 3073 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.19 
 
 		 1568 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  35.37 
 
 		 2286 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  33.11 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  33.58 
 
 		 2486 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  36.05 
 
 		 2585 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.55 
 
 		 6274 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  35.86 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  31.54 
 
 		 3689 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.65 
 
 		 2290 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 2615 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  30.77 
 
 		 997 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  29.45 
 
 		 2387 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 1391 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  29.09 
 
 		 1140 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3273 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  32.12 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.8 
 
 		 2094 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.5 
 
 		 2296 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  24.31 
 
 		 1345 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1806 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1825 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1825 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  29.76 
 
 		 2542 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>