30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4862 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 		 388 aa  800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  35.46 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  34.21 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  34.21 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  34.21 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  32.18 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  33.11 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  32.89 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  30.5 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  32.89 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  32.24 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  31.79 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  31.79 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  31.13 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  31.79 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  29.58 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  32.58 
 
 		 2486 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  27.94 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  31.39 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  31.39 
 
 		 574 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  26.39 
 
 		 1559 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  31.39 
 
 		 581 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  30.15 
 
 		 1568 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 3689 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  31.54 
 
 		 614 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  30.63 
 
 		 1115 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 3073 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  27.5 
 
 		 585 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  33.82 
 
 		 209 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>