44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1998 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  65.31 
 
 		 401 aa  293  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  93.92 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  94.59 
 
 		 558 aa  286  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  93.92 
 
 		 561 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  88.89 
 
 		 566 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  89.93 
 
 		 615 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  88.65 
 
 		 408 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  88.49 
 
 		 615 aa  255  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  87.77 
 
 		 450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  87.05 
 
 		 615 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  85.03 
 
 		 333 aa  250  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  84.89 
 
 		 613 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  84.89 
 
 		 471 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  59.09 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  69.12 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  42.55 
 
 		 701 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  38.24 
 
 		 1559 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  38.24 
 
 		 716 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  33.8 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  33.8 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  33.8 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.72 
 
 		 2585 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  33.82 
 
 		 3073 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  37.32 
 
 		 2286 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  35.07 
 
 		 2486 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  34.38 
 
 		 3689 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  34.87 
 
 		 6274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  33.56 
 
 		 2290 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  33.11 
 
 		 2615 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  35.17 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.87 
 
 		 1568 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  35.04 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  31.16 
 
 		 388 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  29.49 
 
 		 1140 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  30.54 
 
 		 2387 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 3273 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 1391 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 2296 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2542 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  29.1 
 
 		 997 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  36.99 
 
 		 846 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  32.89 
 
 		 1953 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  30.53 
 
 		 1345 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>