36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4151 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  100 
 
 		 1568 aa  3187    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 		 1559 aa  77.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  32.5 
 
 		 471 aa  77.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  27.68 
 
 		 716 aa  77  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 3073 aa  75.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  31.25 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  31.82 
 
 		 615 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  32.7 
 
 		 333 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  31.82 
 
 		 615 aa  73.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  32.19 
 
 		 450 aa  70.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  33.09 
 
 		 268 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  29.93 
 
 		 701 aa  69.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  29.8 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  32.12 
 
 		 614 aa  67.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  32.17 
 
 		 566 aa  68.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  31.33 
 
 		 6274 aa  67  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  33.11 
 
 		 2615 aa  67  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  31.47 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  64.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  28.65 
 
 		 401 aa  64.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  33.07 
 
 		 2286 aa  62.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 1391 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  32.72 
 
 		 3689 aa  61.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  31.54 
 
 		 1140 aa  60.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 2486 aa  60.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  29.87 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 3273 aa  57.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  30.37 
 
 		 388 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  29.45 
 
 		 2585 aa  50.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  57.58 
 
 		 220 aa  49.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  40.28 
 
 		 354 aa  48.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  32.33 
 
 		 428 aa  47.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  26.09 
 
 		 2542 aa  45.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  43.86 
 
 		 1773 aa  45.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>