183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3166 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  35.05 
 
 		 2191 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  30.91 
 
 		 2290 aa  809    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  100 
 
 		 2542 aa  5133    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  33.01 
 
 		 2194 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  30.54 
 
 		 2145 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  30.04 
 
 		 2076 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  32.86 
 
 		 2286 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 2615 aa  393  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  30.01 
 
 		 1140 aa  387  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  32.58 
 
 		 2007 aa  342  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  56.38 
 
 		 846 aa  155  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  39.13 
 
 		 3273 aa  112  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.5 
 
 		 2017 aa  102  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.94 
 
 		 2094 aa  101  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.63 
 
 		 2096 aa  89.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1352 aa  89.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1600 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  26.84 
 
 		 2138 aa  84.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 1391 aa  81.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.13 
 
 		 2117 aa  78.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 474 aa  73.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1834 aa  72.8  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  35.53 
 
 		 614 aa  71.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.38 
 
 		 3333 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  25.61 
 
 		 2443 aa  69.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 927 aa  68.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.93 
 
 		 3456 aa  68.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.31 
 
 		 482 aa  68.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 690 aa  67.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1517 aa  65.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1732 aa  64.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  25.78 
 
 		 396 aa  64.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  39.39 
 
 		 238 aa  64.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25 
 
 		 3027 aa  63.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4177  hypothetical protein  44.83 
 
 		 215 aa  63.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000111276  unclonable  0.000000000183322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  27.61 
 
 		 2059 aa  62.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  24.95 
 
 		 2510 aa  62.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.75 
 
 		 2277 aa  62.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  37.23 
 
 		 2494 aa  62  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  23.09 
 
 		 2534 aa  62  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.77 
 
 		 2658 aa  60.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.8 
 
 		 2497 aa  60.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  28.96 
 
 		 2585 aa  60.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 2942 aa  60.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  44.12 
 
 		 554 aa  60.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.24 
 
 		 2035 aa  60.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.83 
 
 		 1976 aa  59.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.98 
 
 		 1427 aa  58.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  27.14 
 
 		 765 aa  59.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1854 aa  58.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  25.29 
 
 		 2416 aa  58.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 		 2374 aa  58.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 2035 aa  58.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  46.03 
 
 		 628 aa  58.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  34.38 
 
 		 400 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  36.09 
 
 		 1953 aa  57.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 2401 aa  57.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  35.4 
 
 		 788 aa  57.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  35.4 
 
 		 788 aa  57.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  36.36 
 
 		 1681 aa  57  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.75 
 
 		 1271 aa  57.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.41 
 
 		 2652 aa  57  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3597  hypothetical protein  37.66 
 
 		 153 aa  57  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  45.07 
 
 		 232 aa  57  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 2294 aa  56.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  22.96 
 
 		 2283 aa  56.2  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  26.73 
 
 		 2387 aa  55.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 2437 aa  55.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  36.19 
 
 		 311 aa  55.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.61 
 
 		 2149 aa  55.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.8 
 
 		 1348 aa  55.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.76 
 
 		 2731 aa  55.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 3193 aa  55.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  35.14 
 
 		 903 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  35.14 
 
 		 889 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  36.79 
 
 		 1467 aa  54.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1840 aa  55.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1338 aa  54.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.83 
 
 		 1485 aa  54.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1628 aa  54.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  28.84 
 
 		 2225 aa  54.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  23.24 
 
 		 2402 aa  53.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  28.7 
 
 		 1464 aa  53.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  32.09 
 
 		 334 aa  53.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  31.25 
 
 		 1368 aa  53.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.04 
 
 		 765 aa  53.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1547 aa  53.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  43.94 
 
 		 2486 aa  53.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  37.68 
 
 		 468 aa  53.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  26.13 
 
 		 1457 aa  53.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.36 
 
 		 1917 aa  53.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2843 aa  52.8  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  35.9 
 
 		 2349 aa  52.8  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  34.95 
 
 		 1390 aa  52.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.01 
 
 		 1595 aa  52.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.61 
 
 		 2762 aa  52.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0351  hypothetical protein  41.76 
 
 		 262 aa  52.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.50807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.56 
 
 		 2246 aa  52  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1611 aa  52.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1753 aa  52.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>