19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0446 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  50.66 
 
 		 3273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  47.69 
 
 		 2615 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  46.21 
 
 		 1140 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  48.72 
 
 		 2286 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 		 1391 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.96 
 
 		 2585 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  45.53 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  34.31 
 
 		 2290 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  34.97 
 
 		 2542 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  43.48 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  40.38 
 
 		 846 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  44.35 
 
 		 1953 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 2486 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3343  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1426 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  unclonable  0.00184093  hitchhiker  0.000724597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2110  Hedgehog/intein hint domain protein  36.63 
 
 		 184 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000398223  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  34.71 
 
 		 3073 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.98 
 
 		 2296 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2381  hedgehog/intein hint domain-containing protein  31.25 
 
 		 533 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>