10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2110 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2110  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000398223  normal  0.333093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  40.22 
 
 		 1098 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  36.63 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  35.96 
 
 		 715 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  37.23 
 
 		 2585 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2381  hedgehog/intein hint domain-containing protein  29.05 
 
 		 533 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 1412 aa  44.7  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0874  hypothetical protein  28.39 
 
 		 618 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.549464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  29.29 
 
 		 2290 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  29.08 
 
 		 2286 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>