192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2697 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 		 715 aa  1431    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  52.92 
 
 		 698 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  59.51 
 
 		 362 aa  325  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  65.06 
 
 		 368 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  52.54 
 
 		 368 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  64.85 
 
 		 338 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  66.25 
 
 		 345 aa  297  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  63.18 
 
 		 340 aa  296  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  53.66 
 
 		 373 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  64.92 
 
 		 358 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  64.92 
 
 		 341 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  64.92 
 
 		 341 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  62.7 
 
 		 342 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  61.72 
 
 		 339 aa  281  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  61.51 
 
 		 344 aa  278  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  63.18 
 
 		 350 aa  275  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  55.6 
 
 		 357 aa  268  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  56.02 
 
 		 370 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  56.9 
 
 		 329 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  52.26 
 
 		 349 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  53.14 
 
 		 389 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  51.24 
 
 		 338 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  52.3 
 
 		 345 aa  220  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  46.25 
 
 		 320 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  43.08 
 
 		 360 aa  180  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  35.71 
 
 		 350 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  34.67 
 
 		 352 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 385 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  37.13 
 
 		 363 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 352 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 392 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 376 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 374 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  38.03 
 
 		 392 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 392 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 302 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 374 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 352 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.56 
 
 		 391 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 372 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  36.63 
 
 		 385 aa  137  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 		 392 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  36.32 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 		 392 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.62 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  37.04 
 
 		 417 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  36.79 
 
 		 393 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  35.85 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.32 
 
 		 377 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 390 aa  134  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  37.62 
 
 		 381 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  37.13 
 
 		 361 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 374 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 290 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  37.62 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  39.6 
 
 		 361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 352 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  36.45 
 
 		 352 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  30.5 
 
 		 325 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.32 
 
 		 386 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 375 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 352 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  34.43 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  34.6 
 
 		 384 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  34.8 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  34.8 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  37.09 
 
 		 375 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  37.62 
 
 		 360 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  28.97 
 
 		 356 aa  127  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 353 aa  127  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  34.87 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  37.83 
 
 		 357 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  33.85 
 
 		 352 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 390 aa  124  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  35.21 
 
 		 362 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  33.18 
 
 		 358 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 364 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 343 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 360 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 		 350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  37.13 
 
 		 360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 380 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 385 aa  121  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 402 aa  120  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>