47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1002 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  100 
 
 		 614 aa  1233    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  36.96 
 
 		 2615 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 3273 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  46.75 
 
 		 2286 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 3689 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  42.17 
 
 		 1140 aa  98.2  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 		 1391 aa  97.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  41.38 
 
 		 2585 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  39.86 
 
 		 3073 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0446  hedgehog/intein hint domain-containing protein  45.53 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  35.81 
 
 		 2290 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  29.88 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  38.98 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  37.67 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  35.53 
 
 		 2542 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  37.24 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  36.99 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  36.55 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 		 2486 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.12 
 
 		 1568 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  35.86 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  36.55 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  36.3 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  36.55 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  35.17 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  29.44 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  35.17 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  35.17 
 
 		 334 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  32.16 
 
 		 401 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  35.86 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3597  hypothetical protein  49.28 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  34 
 
 		 846 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  35.17 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  34.12 
 
 		 3141 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  34.12 
 
 		 3131 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  37.71 
 
 		 1953 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 1559 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2198  hypothetical protein  26.06 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2043  hypothetical protein  26.06 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0205742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2792  hypothetical protein  26.06 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000062949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2236  hypothetical protein  26.76 
 
 		 161 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91775e-33 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.33 
 
 		 6274 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  31.76 
 
 		 3144 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  30.86 
 
 		 2296 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  31.54 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  35 
 
 		 2387 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1142  hypothetical protein  26.88 
 
 		 155 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0739432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>