54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2030 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  92.94 
 
 		 613 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  95.2 
 
 		 561 aa  812    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  94.63 
 
 		 615 aa  780    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  80.04 
 
 		 566 aa  767    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1128    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  94.85 
 
 		 615 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  95.08 
 
 		 615 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  95.75 
 
 		 450 aa  790    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  78.59 
 
 		 401 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  91.8 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  87.46 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  79.4 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  89.33 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1929  hypothetical protein  95.5 
 
 		 202 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  82.87 
 
 		 251 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  84.78 
 
 		 268 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2014  hypothetical protein  93.89 
 
 		 212 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0271707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1198  hypothetical protein  84.62 
 
 		 117 aa  208  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000623661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2009  hypothetical protein  65.82 
 
 		 209 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.129716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  43.07 
 
 		 701 aa  100  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 1559 aa  88.2  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  32.73 
 
 		 574 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  32.73 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  36.03 
 
 		 716 aa  87.4  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  32.73 
 
 		 581 aa  86.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  36.84 
 
 		 2585 aa  77.4  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1002  hedgehog/intein hint, N-terminal  29.88 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00822748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  33.09 
 
 		 3073 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  35.07 
 
 		 2486 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  36.73 
 
 		 2286 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  33.55 
 
 		 6274 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  32.93 
 
 		 3689 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4151  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  30.77 
 
 		 1568 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  31.79 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  28.89 
 
 		 2290 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 1391 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  31.01 
 
 		 2615 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  30.72 
 
 		 1140 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  36.26 
 
 		 997 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2933  Hedgehog/intein hint domain protein  32.05 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1495 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 3273 aa  54.7  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  30.54 
 
 		 2387 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 2296 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  31.61 
 
 		 2542 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  24.57 
 
 		 1345 aa  50.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1411 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2338  Hedgehog/intein hint domain protein  36.99 
 
 		 846 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.8 
 
 		 2094 aa  47.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  31.61 
 
 		 1953 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1806 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1825 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1825 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  29.9 
 
 		 1773 aa  43.5  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>