More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2855 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  100 
 
 
1825 aa  3616    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  99.67 
 
 
1806 aa  3445    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  98.16 
 
 
2031 aa  3429    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  92.41 
 
 
2032 aa  3323    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  98.54 
 
 
2031 aa  3470    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  98.32 
 
 
2031 aa  3462    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  99.95 
 
 
1825 aa  3611    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.84 
 
 
1976 aa  553  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  29.09 
 
 
2443 aa  248  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.4 
 
 
2479 aa  240  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  24.45 
 
 
2035 aa  233  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.55 
 
 
2059 aa  232  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  30.78 
 
 
2510 aa  205  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 
2558 aa  189  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  27.36 
 
 
2534 aa  183  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.81 
 
 
2652 aa  180  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.2 
 
 
1834 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  24.87 
 
 
2554 aa  166  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  29.55 
 
 
2698 aa  164  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  27.13 
 
 
2117 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  24.12 
 
 
1489 aa  145  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 
1517 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  25.4 
 
 
1496 aa  137  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 
927 aa  135  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  23.2 
 
 
1505 aa  133  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.16 
 
 
2096 aa  133  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.8 
 
 
2017 aa  131  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  24.02 
 
 
1446 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 
690 aa  125  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.37 
 
 
1271 aa  125  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 
628 aa  123  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 
1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 
1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  23.55 
 
 
1540 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  24.47 
 
 
1447 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.24 
 
 
903 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.36 
 
 
1577 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  25.7 
 
 
1528 aa  114  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.48 
 
 
889 aa  113  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  25.04 
 
 
1485 aa  112  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.57 
 
 
2458 aa  108  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.57 
 
 
2417 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  22.34 
 
 
2138 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  21.65 
 
 
2075 aa  102  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  24.2 
 
 
2145 aa  101  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.06 
 
 
741 aa  100  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 
2961 aa  100  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.22 
 
 
788 aa  99.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.22 
 
 
788 aa  99.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.95 
 
 
2094 aa  99.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.04 
 
 
3027 aa  98.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.68 
 
 
1467 aa  98.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.81 
 
 
764 aa  97.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.13 
 
 
1381 aa  97.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 
1600 aa  96.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.8 
 
 
2290 aa  95.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.49 
 
 
705 aa  94.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 
3193 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.06 
 
 
2076 aa  93.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 
2831 aa  93.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 
913 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 
1433 aa  91.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 
1197 aa  90.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.06 
 
 
1595 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 
1959 aa  90.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.06 
 
 
1586 aa  90.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.78 
 
 
1008 aa  89.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.78 
 
 
1008 aa  89.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  22.42 
 
 
1427 aa  88.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 
1352 aa  88.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.45 
 
 
1345 aa  86.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.45 
 
 
1345 aa  86.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.29 
 
 
1576 aa  85.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.09 
 
 
1599 aa  85.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.4 
 
 
1732 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.38 
 
 
2277 aa  83.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 
1763 aa  83.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  24.41 
 
 
3456 aa  82.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.11 
 
 
1140 aa  82.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  22.31 
 
 
2165 aa  82.4  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  21.21 
 
 
2428 aa  82.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 
2294 aa  82  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 
1198 aa  82  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  27.96 
 
 
468 aa  81.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.53 
 
 
1560 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  25.85 
 
 
1488 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 
1390 aa  80.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.29 
 
 
738 aa  80.1  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.97 
 
 
1528 aa  79.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 
605 aa  79.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.41 
 
 
2497 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2953  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 
1127 aa  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628016  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 
2374 aa  77.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 
3073 aa  77  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.03 
 
 
2149 aa  76.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.51 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  21.01 
 
 
1488 aa  74.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23.05 
 
 
917 aa  74.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 
474 aa  73.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 
1942 aa  73.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>