28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0256 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1204    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00336194  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0258  hypothetical protein  94.15 
 
 		 574 aa  1090    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0254  hypothetical protein  94.84 
 
 		 575 aa  1101    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0600263  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0261  hypothetical protein  51.35 
 
 		 346 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2838  hypothetical protein  27.84 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  27.61 
 
 		 615 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  27.14 
 
 		 615 aa  90.5  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  27.53 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1197  hypothetical protein  25.81 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000101518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  32.73 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2030  hypothetical protein  32.73 
 
 		 558 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00279579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1998  hypothetical protein  33.8 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.403474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  32.12 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1979  hypothetical protein  31.52 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0026503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  30.91 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  30.91 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  30.43 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2045  hypothetical protein  31.11 
 
 		 268 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  31.62 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  30.56 
 
 		 2486 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 3073 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2567  Hedgehog/intein hint domain protein  26.06 
 
 		 716 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00023287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 		 1559 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0439  Hedgehog/intein hint domain protein  27.95 
 
 		 701 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4862  Hedgehog/intein hint domain protein  31.39 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0141678  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  26.94 
 
 		 2585 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 3689 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1444  hypothetical protein  32.97 
 
 		 997 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>